Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1207582	1207678	97	9 [0]	[0] 6	manY	mannose‑specific enzyme IIC component of PTS

CCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGC  >  minE/1207520‑1207581                                                              | ccGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGc  <  1:1052189/62‑1 (MQ=255) ccGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGc  <  1:1084388/62‑1 (MQ=255) ccGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGc  <  1:177568/62‑1 (MQ=255) ccGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGc  <  1:315116/62‑1 (MQ=255) ccGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGc  <  1:392244/62‑1 (MQ=255) ccGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGc  <  1:769220/62‑1 (MQ=255) ccGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGc  <  1:847073/62‑1 (MQ=255) ccGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGc  <  1:927836/62‑1 (MQ=255)                aaTGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGc  <  1:1147682/47‑1 (MQ=255)                                                              | CCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGTGGTTGGTTATGC  >  minE/1207520‑1207581

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑