Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	87428	87446	19	9 [0]	[0] 25	ddlB	D‑Alanine:D‑alanine ligase

CAGAAATTTCTGCTCTGGGTTTGCCGGTTATCGTTAAGCCGAGCCGCGAAGGTTCCAGTGT  >  minE/87367‑87427                                                             | gaGAAATTTCTGCTCTGGGTTTGCCGGTTATCGTTAAGCCGAGCCGCGAAGGTTCCAgtgt  <  1:341466/60‑1 (MQ=255) cAGAAATTTCTGCTCTGGGTTTGCCGGTTATCGTTAAGCCGAGCCGCGAAGGTTCCAgtgt  <  1:233197/61‑1 (MQ=255) cAGAAATTTCTGCTCTGGGTTTGCCGGTTATCGTTAAGCCGAGCCGCGAAGGTTCCAgtgt  <  1:47107/61‑1 (MQ=255) cAGAAATTTCTGCTCTGGGTTTGCCGGTTATCGTTAAGCCGAGCCGCGAAGGTTCCAgtgt  <  1:474403/61‑1 (MQ=255) cAGAAATTTCTGCTCTGGGTTTGCCGGTTATCGTTAAGCCGAGCCGCGAAGGTTCCAgtgt  <  1:483638/61‑1 (MQ=255) cAGAAATTTCTGCTCTGGGTTTGCCGGTTATCGTTAAGCCGAGCCGCGAAGGTTCCAgtgt  <  1:81516/61‑1 (MQ=255) cAGAAATTTCTGCTCTGGGTTTGCCGGTTATCGTTAAGCCGAGCCGCGAAGGTTCCAgtgt  <  1:969887/61‑1 (MQ=255) cAGAAATTTCTGCTCTGGGTTTGCCGGTTATCGTTAAGCCGAGCCGCGAAGGTTCCAgtgt  <  1:988294/61‑1 (MQ=255)                          ggTTATCGTTAAGCCGAGCCGCGAAGGTTCCAgtgt  <  1:568077/36‑1 (MQ=255)                                                             | CAGAAATTTCTGCTCTGGGTTTGCCGGTTATCGTTAAGCCGAGCCGCGAAGGTTCCAGTGT  >  minE/87367‑87427

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑