Missing coverage evidence...
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GGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCAC  >  minE/1256523‑1256582                                                            | ggTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGcac  <  1:488437/60‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGcac  <  1:995795/60‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGcac  <  1:979419/60‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGcac  <  1:898557/60‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGcac  <  1:875983/60‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGcac  <  1:875702/60‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGcac  <  1:8328/60‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGcac  <  1:817399/60‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGcac  <  1:799424/60‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGcac  <  1:729822/60‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGcac  <  1:664011/60‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGcac  <  1:627579/60‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGcac  <  1:509715/60‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGcac  <  1:1009300/60‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGcac  <  1:487738/60‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGcac  <  1:485130/60‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGcac  <  1:347036/60‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGcac  <  1:298710/60‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGcac  <  1:297858/60‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGcac  <  1:258941/60‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGcac  <  1:242692/60‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGcac  <  1:237576/60‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGcac  <  1:1168243/60‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGcac  <  1:116789/60‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGcac  <  1:1148526/60‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGcac  <  1:1106006/60‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGcac  <  1:1076218/60‑1 (MQ=255)     cTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGcac  <  1:676834/56‑1 (MQ=255)                 tGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGcac  <  1:94389/44‑1 (MQ=255)                                                            | GGTGCTGGCGAATCTTTGGTATATGCCCTGGGAGTTGGTTTTCTCCCTGCGTTAGCGCAC  >  minE/1256523‑1256582

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑