Missing coverage evidence...
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CGACGCCAACCCGCAGTCAGCGAAAATTGCGACATTATCTGC  >  minE/1280441‑1280482                                          | cGACGCCAACCCGCAGTCAGCGAAAATTGCGACATTATCTGc  <  1:270355/42‑1 (MQ=255) cGACGCCAACCCGCAGTCAGCGAAAATTGCGACATTATCTGc  <  1:950399/42‑1 (MQ=255) cGACGCCAACCCGCAGTCAGCGAAAATTGCGACATTATCTGc  <  1:831576/42‑1 (MQ=255) cGACGCCAACCCGCAGTCAGCGAAAATTGCGACATTATCTGc  <  1:798449/42‑1 (MQ=255) cGACGCCAACCCGCAGTCAGCGAAAATTGCGACATTATCTGc  <  1:761746/42‑1 (MQ=255) cGACGCCAACCCGCAGTCAGCGAAAATTGCGACATTATCTGc  <  1:676245/42‑1 (MQ=255) cGACGCCAACCCGCAGTCAGCGAAAATTGCGACATTATCTGc  <  1:636010/42‑1 (MQ=255) cGACGCCAACCCGCAGTCAGCGAAAATTGCGACATTATCTGc  <  1:431164/42‑1 (MQ=255) cGACGCCAACCCGCAGTCAGCGAAAATTGCGACATTATCTGc  <  1:423003/42‑1 (MQ=255) cGACGCCAACCCGCAGTCAGCGAAAATTGCGACATTATCTGc  <  1:366345/42‑1 (MQ=255) cGACGCCAACCCGCAGTCAGCGAAAATTGCGACATTATCTGc  <  1:333972/42‑1 (MQ=255) cGACGCCAACCCGCAGTCAGCGAAAATTGCGACATTATCTGc  <  1:288944/42‑1 (MQ=255) cGACGCCAACCCGCAGTCAGCGAAAATTGCGACATTATCTGc  <  1:100145/42‑1 (MQ=255) cGACGCCAACCCGCAGTCAGCGAAAATTGCGACATTATCTGc  <  1:228816/42‑1 (MQ=255) cGACGCCAACCCGCAGTCAGCGAAAATTGCGACATTATCTGc  <  1:163936/42‑1 (MQ=255) cGACGCCAACCCGCAGTCAGCGAAAATTGCGACATTATCTGc  <  1:1168605/42‑1 (MQ=255) cGACGCCAACCCGCAGTCAGCGAAAATTGCGACATTATCTGc  <  1:1163993/42‑1 (MQ=255) cGACGCCAACCCGCAGTCAGCGAAAATTGCGACATTATCTGc  <  1:1152480/42‑1 (MQ=255) cGACGCCAACCCGCAGTCAGCGAAAATTGCGACATTATCTGc  <  1:1119175/42‑1 (MQ=255) cGACGCCAACCCGCAGTCAGCGAAAATTGCGACATTATCTGc  <  1:1078288/42‑1 (MQ=255) cGACGCCAACCCGCAGTCAGCGAAAATTGCGACATTATCTGc  <  1:1034336/42‑1 (MQ=255) cGACGCCAACCCGCAGTCAGCGAAAATTGCGACATTATCTGc  <  1:1007726/42‑1 (MQ=255) cGACGCCAACCCGCAGGCAGCGAAAATTGCGACATTATCTGc  <  1:1108863/42‑1 (MQ=255) cGACGCCAACCCGAAGTCAGCGAAAATTGCGACATTATCTGc  <  1:471263/42‑1 (MQ=255)  gACGCCAACCCGCAGTCAGCGAAAATTGCGACATTATCTGc  <  1:1133928/41‑1 (MQ=255)                                          | CGACGCCAACCCGCAGTCAGCGAAAATTGCGACATTATCTGC  >  minE/1280441‑1280482

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑