Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1286991	1287005	15	30 [0]	[0] 38	shiA	shikimate transporter

AAAAGACAGTACAAACAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACTCGTCCCGATGAAG  >  minE/1286929‑1286990                                                              | aaaaTACAGTACAAACAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACTCGTCCCGATGAAg  <  1:1013707/62‑1 (MQ=255) aaaaGACAGTACAACCAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACTCGTCCCGATGAAg  <  1:1060652/62‑1 (MQ=255) aaaaGACAGTACAAACAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACTCGTCCCGATGAAg  <  1:992973/62‑1 (MQ=255) aaaaGACAGTACAAACAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACTCGTCCCGATGAAg  <  1:1013660/62‑1 (MQ=255) aaaaGACAGTACAAACAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACTCGTCCCGATGAAg  <  1:965034/62‑1 (MQ=255) aaaaGACAGTACAAACAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACTCGTCCCGATGAAg  <  1:901748/62‑1 (MQ=255) aaaaGACAGTACAAACAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACTCGTCCCGATGAAg  <  1:805895/62‑1 (MQ=255) aaaaGACAGTACAAACAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACTCGTCCCGATGAAg  <  1:779592/62‑1 (MQ=255) aaaaGACAGTACAAACAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACTCGTCCCGATGAAg  <  1:75724/62‑1 (MQ=255) aaaaGACAGTACAAACAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACTCGTCCCGATGAAg  <  1:740210/62‑1 (MQ=255) aaaaGACAGTACAAACAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACTCGTCCCGATGAAg  <  1:729276/62‑1 (MQ=255) aaaaGACAGTACAAACAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACTCGTCCCGATGAAg  <  1:708449/62‑1 (MQ=255) aaaaGACAGTACAAACAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACTCGTCCCGATGAAg  <  1:694667/62‑1 (MQ=255) aaaaGACAGTACAAACAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACTCGTCCCGATGAAg  <  1:665463/62‑1 (MQ=255) aaaaGACAGTACAAACAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACTCGTCCCGATGAAg  <  1:624265/62‑1 (MQ=255) aaaaGACAGTACAAACAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACTCGTCCCGATGAAg  <  1:532265/62‑1 (MQ=255) aaaaGACAGTACAAACAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACTCGTCCCGATGAAg  <  1:458413/62‑1 (MQ=255) aaaaGACAGTACAAACAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACTCGTCCCGATGAAg  <  1:42666/62‑1 (MQ=255) aaaaGACAGTACAAACAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACTCGTCCCGATGAAg  <  1:423868/62‑1 (MQ=255) aaaaGACAGTACAAACAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACTCGTCCCGATGAAg  <  1:406777/62‑1 (MQ=255) aaaaGACAGTACAAACAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACTCGTCCCGATGAAg  <  1:306187/62‑1 (MQ=255) aaaaGACAGTACAAACAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACTCGTCCCGATGAAg  <  1:26182/62‑1 (MQ=255) aaaaGACAGTACAAACAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACTCGTCCCGATGAAg  <  1:148218/62‑1 (MQ=255) aaaaGACAGTACAAACAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACTCGTCCCGATGAAg  <  1:1074789/62‑1 (MQ=255) aaaaGACAGTACAAACAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACTCGTCCCGATGAAg  <  1:1020272/62‑1 (MQ=255) aaaaGACAGTACAAACACGATCAGTATGGACTCCACGCTCATCTCCACTCGTCCCGATGAAg  <  1:626759/62‑1 (MQ=255)  aaaGACAGTACAAACATGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACTCGTCCCGATGAAg  <  1:1097288/61‑1 (MQ=255)          tACAAACAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACTCGTCCCGATGAAg  <  1:1124745/53‑1 (MQ=255)               aCAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACTCGTCCCGATGAAg  <  1:151974/48‑1 (MQ=255)                   gATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACTCGTCCCGATGAAg  <  1:418530/44‑1 (MQ=255)                                                              | AAAAGACAGTACAAACAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACTCGTCCCGATGAAG  >  minE/1286929‑1286990

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑