Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1287067 1287113 47 45 [0] [0] 27 shiA shikimate transporter

GTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGATTT  >  minE/1287006‑1287066
                                                            |
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:78619/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:57088/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:1015574/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:615599/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:62725/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:652194/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:692224/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:717279/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:732315/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:746392/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:767058/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:575269/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:805478/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:833696/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:873705/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:883368/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:887387/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:891576/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:92401/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:972624/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:97915/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:312760/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:1059105/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:1112925/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:1166829/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:1184816/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:182824/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:199252/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:199273/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:544460/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:416565/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:422550/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:425634/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:436839/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:49301/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:496770/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:510211/61‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTAAGAttt  <  1:250131/61‑1 (MQ=255)
 tCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:308317/60‑1 (MQ=255)
 tCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:847853/60‑1 (MQ=255)
 tCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:684423/60‑1 (MQ=255)
   gcgcCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:611265/58‑1 (MQ=255)
       cggacgaGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:347774/52‑1 (MQ=255)
                   gTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:270792/42‑1 (MQ=255)
                        gCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGAttt  <  1:724031/37‑1 (MQ=255)
                                                            |
GTCGCGCCCGACGAGCTGCGTTAGGCAGCTTCGCTGGTGCCGTCGTCGACTGGTATGATTT  >  minE/1287006‑1287066

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: