Missing coverage evidence...
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GGTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTA  >  minE/1287701‑1287761                                                             | ggTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:869741/61‑1 (MQ=255) ggTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:629340/61‑1 (MQ=255) ggTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:646800/61‑1 (MQ=255) ggTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:657789/61‑1 (MQ=255) ggTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:718824/61‑1 (MQ=255) ggTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:732761/61‑1 (MQ=255) ggTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:779709/61‑1 (MQ=255) ggTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:844179/61‑1 (MQ=255) ggTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:857151/61‑1 (MQ=255) ggTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:1122252/61‑1 (MQ=255) ggTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:875851/61‑1 (MQ=255) ggTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:879043/61‑1 (MQ=255) ggTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:90314/61‑1 (MQ=255) ggTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:927079/61‑1 (MQ=255) ggTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:929343/61‑1 (MQ=255) ggTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:955210/61‑1 (MQ=255) ggTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:964724/61‑1 (MQ=255) ggTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:446686/61‑1 (MQ=255) ggTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:1148727/61‑1 (MQ=255) ggTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:1165198/61‑1 (MQ=255) ggTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:1169051/61‑1 (MQ=255) ggTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:133961/61‑1 (MQ=255) ggTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:167379/61‑1 (MQ=255) ggTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:168907/61‑1 (MQ=255) ggTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:172985/61‑1 (MQ=255) ggTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:274742/61‑1 (MQ=255) ggTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:311995/61‑1 (MQ=255) ggTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:341437/61‑1 (MQ=255) ggTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:391105/61‑1 (MQ=255) ggTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:394319/61‑1 (MQ=255) ggTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:414185/61‑1 (MQ=255) ggTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:455180/61‑1 (MQ=255)  gTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:1045815/60‑1 (MQ=255)  gTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:995800/60‑1 (MQ=255)   tGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTa  <  1:986114/59‑1 (MQ=255)                                                             | GGTGCTTTCCTGAAGATTATTGCGCTACGACTGTGCGAATTGCTGACGATGTACATCGTTA  >  minE/1287701‑1287761

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑