Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1317474	1317545	72	35 [0]	[0] 11	[hisI]	[hisI]

CTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTA  >  minE/1317412‑1317473                                                              | cTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTa  >  1:789841/1‑62 (MQ=255) cTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTa  >  1:506309/1‑62 (MQ=255) cTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTa  >  1:548253/1‑62 (MQ=255) cTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTa  >  1:592549/1‑62 (MQ=255) cTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTa  >  1:637379/1‑62 (MQ=255) cTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTa  >  1:66963/1‑62 (MQ=255) cTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTa  >  1:722908/1‑62 (MQ=255) cTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTa  >  1:728675/1‑62 (MQ=255) cTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTa  >  1:767545/1‑62 (MQ=255) cTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTa  >  1:1070641/1‑62 (MQ=255) cTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTa  >  1:845730/1‑62 (MQ=255) cTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTa  >  1:850228/1‑62 (MQ=255) cTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTa  >  1:858470/1‑62 (MQ=255) cTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTa  >  1:881915/1‑62 (MQ=255) cTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTa  >  1:917004/1‑62 (MQ=255) cTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTa  >  1:961321/1‑62 (MQ=255) cTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTa  >  1:964399/1‑62 (MQ=255) cTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTa  >  1:99545/1‑62 (MQ=255) cTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTa  >  1:270205/1‑62 (MQ=255) cTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTa  >  1:1007414/1‑62 (MQ=255) cTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTa  >  1:1075158/1‑62 (MQ=255) cTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTa  >  1:107563/1‑62 (MQ=255) cTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTa  >  1:1154189/1‑62 (MQ=255) cTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTa  >  1:1198364/1‑62 (MQ=255) cTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTa  >  1:205079/1‑62 (MQ=255) cTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTa  >  1:224600/1‑62 (MQ=255) cTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTa  >  1:252568/1‑62 (MQ=255) cTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTa  >  1:304805/1‑62 (MQ=255) cTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTa  >  1:306287/1‑62 (MQ=255) cTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTa  >  1:328887/1‑62 (MQ=255) cTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTa  >  1:354035/1‑62 (MQ=255) cTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTa  >  1:358685/1‑62 (MQ=255) cTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTa  >  1:402895/1‑62 (MQ=255) cTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAAAGACGGTa  >  1:479085/1‑62 (MQ=255) cTGATTTGATGTATCACCTGATGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTa  >  1:311577/1‑62 (MQ=255)                                                              | CTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTA  >  minE/1317412‑1317473

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑