Missing coverage evidence...
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TTCAGTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCCCGAGCACAGAAC  >  minE/1327162‑1327221                                                            | ttCAGTGCCTGATGCGACGCTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCCCGAGCACAGAAc  >  1:620975/1‑60 (MQ=255) ttCAGTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCCCGAGCACAGAAc  >  1:542008/1‑60 (MQ=255) ttCAGTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCCCGAGCACAGAAc  >  1:994192/1‑60 (MQ=255) ttCAGTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCCCGAGCACAGAAc  >  1:956291/1‑60 (MQ=255) ttCAGTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCCCGAGCACAGAAc  >  1:947355/1‑60 (MQ=255) ttCAGTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCCCGAGCACAGAAc  >  1:909425/1‑60 (MQ=255) ttCAGTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCCCGAGCACAGAAc  >  1:874266/1‑60 (MQ=255) ttCAGTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCCCGAGCACAGAAc  >  1:85491/1‑60 (MQ=255) ttCAGTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCCCGAGCACAGAAc  >  1:808900/1‑60 (MQ=255) ttCAGTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCCCGAGCACAGAAc  >  1:777563/1‑60 (MQ=255) ttCAGTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCCCGAGCACAGAAc  >  1:736121/1‑60 (MQ=255) ttCAGTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCCCGAGCACAGAAc  >  1:722090/1‑60 (MQ=255) ttCAGTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCCCGAGCACAGAAc  >  1:715017/1‑60 (MQ=255) ttCAGTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCCCGAGCACAGAAc  >  1:710818/1‑60 (MQ=255) ttCAGTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCCCGAGCACAGAAc  >  1:68596/1‑60 (MQ=255) ttCAGTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCCCGAGCACAGAAc  >  1:591225/1‑60 (MQ=255) ttCAGTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCCCGAGCACAGAAc  >  1:1088191/1‑60 (MQ=255) ttCAGTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCCCGAGCACAGAAc  >  1:493148/1‑60 (MQ=255) ttCAGTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCCCGAGCACAGAAc  >  1:476632/1‑60 (MQ=255) ttCAGTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCCCGAGCACAGAAc  >  1:475353/1‑60 (MQ=255) ttCAGTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCCCGAGCACAGAAc  >  1:45246/1‑60 (MQ=255) ttCAGTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCCCGAGCACAGAAc  >  1:407616/1‑60 (MQ=255) ttCAGTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCCCGAGCACAGAAc  >  1:398768/1‑60 (MQ=255) ttCAGTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCCCGAGCACAGAAc  >  1:397233/1‑60 (MQ=255) ttCAGTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCCCGAGCACAGAAc  >  1:354021/1‑60 (MQ=255) ttCAGTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCCCGAGCACAGAAc  >  1:22644/1‑60 (MQ=255) ttCAGTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCCCGAGCACAGAAc  >  1:187308/1‑60 (MQ=255) ttCAGTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCCCGAGCACAGAAc  >  1:1186589/1‑60 (MQ=255) ttCAGTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCCCGAGCACAGAAc  >  1:1123394/1‑60 (MQ=255) ttCAGTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCCCGAGCACAGAAc  >  1:1112299/1‑60 (MQ=255) ttCAGTGCCTGATGCCACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCCCGAGCACAGAAc  >  1:1144540/1‑60 (MQ=255)                                                            | TTCAGTGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACAGGTCCCGAGCACAGAAC  >  minE/1327162‑1327221

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑