Missing coverage evidence...
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CACCGCCAGCGCCTCACGGCTAAAATGCTGTTCCACGCGGTTAATCGCCTCAACGGGTTGCGCCAGTTTGCTGTTGATCTCACCGCT  >  minE/1330374‑1330460                                                             |                           cACCGCCAGCGCCTCACGGCTAAAATGCTGTTCCACTCGGTTAATCGCCTCAACGGGTTgc                            >  1:37726/1‑61 (MQ=255) cACCGCCAGCGCCTCACGGCTAAAATGCTGTTCCACGCGGTTAATCGCCTCAACGGGTTgc                            >  1:397235/1‑61 (MQ=255) cACCGCCAGCGCCTCACGGCTAAAATGCTGTTCCACGCGGTTAATCGCCTCAACGGGTTgc                            >  1:957711/1‑61 (MQ=255) cACCGCCAGCGCCTCACGGCTAAAATGCTGTTCCACGCGGTTAATCGCCTCAACGGGTTgc                            >  1:945652/1‑61 (MQ=255) cACCGCCAGCGCCTCACGGCTAAAATGCTGTTCCACGCGGTTAATCGCCTCAACGGGTTgc                            >  1:893362/1‑61 (MQ=255) cACCGCCAGCGCCTCACGGCTAAAATGCTGTTCCACGCGGTTAATCGCCTCAACGGGTTgc                            >  1:827936/1‑61 (MQ=255) cACCGCCAGCGCCTCACGGCTAAAATGCTGTTCCACGCGGTTAATCGCCTCAACGGGTTgc                            >  1:747638/1‑61 (MQ=255) cACCGCCAGCGCCTCACGGCTAAAATGCTGTTCCACGCGGTTAATCGCCTCAACGGGTTgc                            >  1:733410/1‑61 (MQ=255) cACCGCCAGCGCCTCACGGCTAAAATGCTGTTCCACGCGGTTAATCGCCTCAACGGGTTgc                            >  1:672865/1‑61 (MQ=255) cACCGCCAGCGCCTCACGGCTAAAATGCTGTTCCACGCGGTTAATCGCCTCAACGGGTTgc                            >  1:644218/1‑61 (MQ=255) cACCGCCAGCGCCTCACGGCTAAAATGCTGTTCCACGCGGTTAATCGCCTCAACGGGTTgc                            >  1:628518/1‑61 (MQ=255) cACCGCCAGCGCCTCACGGCTAAAATGCTGTTCCACGCGGTTAATCGCCTCAACGGGTTgc                            >  1:611928/1‑61 (MQ=255) cACCGCCAGCGCCTCACGGCTAAAATGCTGTTCCACGCGGTTAATCGCCTCAACGGGTTgc                            >  1:58740/1‑61 (MQ=255) cACCGCCAGCGCCTCACGGCTAAAATGCTGTTCCACGCGGTTAATCGCCTCAACGGGTTgc                            >  1:552865/1‑61 (MQ=255) cACCGCCAGCGCCTCACGGCTAAAATGCTGTTCCACGCGGTTAATCGCCTCAACGGGTTgc                            >  1:460069/1‑61 (MQ=255) cACCGCCAGCGCCTCACGGCTAAAATGCTGTTCCACGCGGTTAATCGCCTCAACGGGTTgc                            >  1:451750/1‑61 (MQ=255) cACCGCCAGCGCCTCACGGCTAAAATGCTGTTCCACGCGGTTAATCGCCTCAACGGGTTgc                            >  1:401780/1‑61 (MQ=255) cACCGCCAGCGCCTCACGGCTAAAATGCTGTTCCACGCGGTTAATCGCCTCAACGGGTTgc                            >  1:1072425/1‑61 (MQ=255) cACCGCCAGCGCCTCACGGCTAAAATGCTGTTCCACGCGGTTAATCGCCTCAACGGGTTgc                            >  1:392892/1‑61 (MQ=255) cACCGCCAGCGCCTCACGGCTAAAATGCTGTTCCACGCGGTTAATCGCCTCAACGGGTTgc                            >  1:357011/1‑61 (MQ=255) cACCGCCAGCGCCTCACGGCTAAAATGCTGTTCCACGCGGTTAATCGCCTCAACGGGTTgc                            >  1:352294/1‑61 (MQ=255) cACCGCCAGCGCCTCACGGCTAAAATGCTGTTCCACGCGGTTAATCGCCTCAACGGGTTgc                            >  1:351371/1‑61 (MQ=255) cACCGCCAGCGCCTCACGGCTAAAATGCTGTTCCACGCGGTTAATCGCCTCAACGGGTTgc                            >  1:280167/1‑61 (MQ=255) cACCGCCAGCGCCTCACGGCTAAAATGCTGTTCCACGCGGTTAATCGCCTCAACGGGTTgc                            >  1:233499/1‑61 (MQ=255) cACCGCCAGCGCCTCACGGCTAAAATGCTGTTCCACGCGGTTAATCGCCTCAACGGGTTgc                            >  1:187228/1‑61 (MQ=255) cACCGCCAGCGCCTCACGGCTAAAATGCTGTTCCACGCGGTTAATCGCCTCAACGGGTTgc                            >  1:157156/1‑61 (MQ=255) cACCGCCAGCGCCTCACGGCTAAAATGCTGTTCCACGCGGTTAATCGCCTCAACGGGTTgc                            >  1:1198867/1‑61 (MQ=255) cACCGCCAGCGCCTCACGGCTAAAATGCTGTTCCACGCGGTTAATCGCCTCAACGGGTTgc                            >  1:117354/1‑61 (MQ=255) cACCGCCAGCGCCTCACGGCTAAAATGCTGTTCCACGCGGTTAATCGCCTCAACGGGTTgc                            >  1:116207/1‑61 (MQ=255) cACCGCCAGCGCCTCACGGCTAAAATGCTGTTCCACGCGGTTAATCGCCTCAACGGGTTgc                            >  1:1112297/1‑61 (MQ=255)                          tGCTGTTCCACGCGGTTAATCGCCTCAACGGGTTGCGCCAGTTTGCTGTTGATCTCACCGCt  <  1:240912/62‑1 (MQ=255)                                                             |                           CACCGCCAGCGCCTCACGGCTAAAATGCTGTTCCACGCGGTTAATCGCCTCAACGGGTTGCGCCAGTTTGCTGTTGATCTCACCGCT  >  minE/1330374‑1330460

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑