Missing coverage evidence...
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TACCAGATCTTTCACCCCGACGGTGGTGACCAGGCCAGATTCAGCATACACATAGCTGTTTT  >  minE/1332140‑1332201                                                              | tACCAGATCTTTCACCCCGACGGTGGTGAGCAGGCCAGATTCAGCATACACATAGCTGtttt  <  1:438551/62‑1 (MQ=255) tACCAGATCTTTCACCCCGACGGTGGTGACCAGGCCAGATTCAGCATACACATAGCTGtttt  <  1:43219/62‑1 (MQ=255) tACCAGATCTTTCACCCCGACGGTGGTGACCAGGCCAGATTCAGCATACACATAGCTGtttt  <  1:951229/62‑1 (MQ=255) tACCAGATCTTTCACCCCGACGGTGGTGACCAGGCCAGATTCAGCATACACATAGCTGtttt  <  1:749434/62‑1 (MQ=255) tACCAGATCTTTCACCCCGACGGTGGTGACCAGGCCAGATTCAGCATACACATAGCTGtttt  <  1:681614/62‑1 (MQ=255) tACCAGATCTTTCACCCCGACGGTGGTGACCAGGCCAGATTCAGCATACACATAGCTGtttt  <  1:679103/62‑1 (MQ=255) tACCAGATCTTTCACCCCGACGGTGGTGACCAGGCCAGATTCAGCATACACATAGCTGtttt  <  1:672677/62‑1 (MQ=255) tACCAGATCTTTCACCCCGACGGTGGTGACCAGGCCAGATTCAGCATACACATAGCTGtttt  <  1:516690/62‑1 (MQ=255) tACCAGATCTTTCACCCCGACGGTGGTGACCAGGCCAGATTCAGCATACACATAGCTGtttt  <  1:481248/62‑1 (MQ=255) tACCAGATCTTTCACCCCGACGGTGGTGACCAGGCCAGATTCAGCATACACATAGCTGtttt  <  1:457045/62‑1 (MQ=255) tACCAGATCTTTCACCCCGACGGTGGTGACCAGGCCAGATTCAGCATACACATAGCTGtttt  <  1:456051/62‑1 (MQ=255) tACCAGATCTTTCACCCCGACGGTGGTGACCAGGCCAGATTCAGCATACACATAGCTGtttt  <  1:1054330/62‑1 (MQ=255) tACCAGATCTTTCACCCCGACGGTGGTGACCAGGCCAGATTCAGCATACACATAGCTGtttt  <  1:407851/62‑1 (MQ=255) tACCAGATCTTTCACCCCGACGGTGGTGACCAGGCCAGATTCAGCATACACATAGCTGtttt  <  1:347342/62‑1 (MQ=255) tACCAGATCTTTCACCCCGACGGTGGTGACCAGGCCAGATTCAGCATACACATAGCTGtttt  <  1:339567/62‑1 (MQ=255) tACCAGATCTTTCACCCCGACGGTGGTGACCAGGCCAGATTCAGCATACACATAGCTGtttt  <  1:306523/62‑1 (MQ=255) tACCAGATCTTTCACCCCGACGGTGGTGACCAGGCCAGATTCAGCATACACATAGCTGtttt  <  1:300694/62‑1 (MQ=255) tACCAGATCTTTCACCCCGACGGTGGTGACCAGGCCAGATTCAGCATACACATAGCTGtttt  <  1:285474/62‑1 (MQ=255) tACCAGATCTTTCACCCCGACGGTGGTGACCAGGCCAGATTCAGCATACACATAGCTGtttt  <  1:205744/62‑1 (MQ=255) tACCAGATCTTTCACCCCGACGGTGGTGACCAGGCCAGATTCAGCATACACATAGCTGtttt  <  1:187847/62‑1 (MQ=255) tACCAGATCTTTCACCCCGACGGTGGTGACCAGGCCAGATTCAGCATACACATAGCTGtttt  <  1:18073/62‑1 (MQ=255) tACCAGATCTTTCACCCCGACGGTGGTGACCAGGCCAGATTCAGCATACACATAGCCGtttt  <  1:1157668/62‑1 (MQ=255)  aCCAGATCTTTCACCCCGACGGTGGTGACCAGGCCAGATTCAGCATACACATAGCTGtttt  <  1:639607/61‑1 (MQ=255)  aCCAGATCTTTCACCCCGACGGTGGTGACCAGGCCAGATTCAGCATACACATAGCTGtttt  <  1:186946/61‑1 (MQ=255)                                                              | TACCAGATCTTTCACCCCGACGGTGGTGACCAGGCCAGATTCAGCATACACATAGCTGTTTT  >  minE/1332140‑1332201

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑