Missing coverage evidence...
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ACCACCGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATGGTGAGAT  >  minE/1332954‑1333017                                                         |        accaccTGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:479689/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCTGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:762337/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:713698/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:476665/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:575422/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:6075/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:617263/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:648303/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:661666/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:673736/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:680129/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:683928/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:398946/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:729179/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:729615/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:902001/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:932109/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:958259/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:965870/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:99532/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:995852/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:182029/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:1031740/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:1126578/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:1150444/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:1168608/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:1181270/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:1188771/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:143787/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:156369/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:164206/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:173153/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:1000231/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:227601/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:230568/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:30046/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:31087/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:315094/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:34153/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:349822/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:377972/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATg         >  1:393821/1‑57 (MQ=255) accaccGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGG‑‑GATGGTGGTTTGCAGCATGGTGAGAt  >  1:665587/1‑62 (MQ=255)                                                         |        ACCACCGGGCTTTCGCACTCCACGCCGTTCAGGCGGCAGATGGTGGTTTGCAGCATGGTGAGAT  >  minE/1332954‑1333017

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑