Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1338504	1338543	40	27 [0]	[0] 37	wcaD	predicted colanic acid polymerase

CCCATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACAA  >  minE/1338442‑1338503                                                              | cccATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACaa  >  1:453749/1‑62 (MQ=255) cccATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACaa  >  1:982289/1‑62 (MQ=255) cccATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACaa  >  1:941737/1‑62 (MQ=255) cccATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACaa  >  1:915548/1‑62 (MQ=255) cccATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACaa  >  1:903904/1‑62 (MQ=255) cccATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACaa  >  1:895323/1‑62 (MQ=255) cccATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACaa  >  1:779968/1‑62 (MQ=255) cccATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACaa  >  1:772428/1‑62 (MQ=255) cccATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACaa  >  1:771324/1‑62 (MQ=255) cccATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACaa  >  1:723604/1‑62 (MQ=255) cccATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACaa  >  1:66274/1‑62 (MQ=255) cccATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACaa  >  1:627983/1‑62 (MQ=255) cccATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACaa  >  1:520233/1‑62 (MQ=255) cccATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACaa  >  1:513768/1‑62 (MQ=255) cccATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACaa  >  1:1028049/1‑62 (MQ=255) cccATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACaa  >  1:41504/1‑62 (MQ=255) cccATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACaa  >  1:338828/1‑62 (MQ=255) cccATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACaa  >  1:302364/1‑62 (MQ=255) cccATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACaa  >  1:285350/1‑62 (MQ=255) cccATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACaa  >  1:187065/1‑62 (MQ=255) cccATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACaa  >  1:179893/1‑62 (MQ=255) cccATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACaa  >  1:128385/1‑62 (MQ=255) cccATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACaa  >  1:1173774/1‑62 (MQ=255) cccATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACaa  >  1:1167192/1‑62 (MQ=255) cccATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACaa  >  1:1136639/1‑62 (MQ=255) cccATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACaa  >  1:110360/1‑62 (MQ=255) cccATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACaa  >  1:1089690/1‑62 (MQ=255)                                                              | CCCATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACAA  >  minE/1338442‑1338503

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑