Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1352942	1352951	10	21 [0]	[0] 88	thiM	hydoxyethylthiazole kinase

ACAGCAGGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACG  >  minE/1352880‑1352941                                                              | acaGCAGGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACg  <  1:525639/62‑1 (MQ=255) acaGCAGGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACg  <  1:984082/62‑1 (MQ=255) acaGCAGGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACg  <  1:977436/62‑1 (MQ=255) acaGCAGGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACg  <  1:968074/62‑1 (MQ=255) acaGCAGGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACg  <  1:830189/62‑1 (MQ=255) acaGCAGGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACg  <  1:710490/62‑1 (MQ=255) acaGCAGGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACg  <  1:693055/62‑1 (MQ=255) acaGCAGGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACg  <  1:621093/62‑1 (MQ=255) acaGCAGGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACg  <  1:614225/62‑1 (MQ=255) acaGCAGGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACg  <  1:582019/62‑1 (MQ=255) acaGCAGGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACg  <  1:542121/62‑1 (MQ=255) acaGCAGGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACg  <  1:1146018/62‑1 (MQ=255) acaGCAGGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACg  <  1:477938/62‑1 (MQ=255) acaGCAGGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACg  <  1:352265/62‑1 (MQ=255) acaGCAGGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACg  <  1:348102/62‑1 (MQ=255) acaGCAGGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACg  <  1:278951/62‑1 (MQ=255) acaGCAGGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACg  <  1:140308/62‑1 (MQ=255) acaGCAGGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACg  <  1:126124/62‑1 (MQ=255) acaGCAGGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACg  <  1:12252/62‑1 (MQ=255) acaGCAGGCAGCGACAAACGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACg  <  1:1176748/62‑1 (MQ=255)                   cgccgATTATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACg  <  1:261249/44‑1 (MQ=255)                                                              | ACAGCAGGCAGCGACAACCGCCGATAATGCACAGCCAGTTCCTACCACTTTGGTCATTAACG  >  minE/1352880‑1352941

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑