Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1353408	1353452	45	13 [0]	[0] 2	thiM	hydoxyethylthiazole kinase

TCTTCGGTTTCGATAACCATCGCTGGCGATGCACCGAGCGCCAGCAAGGTATTGGCGGTAAA  >  minE/1353346‑1353407                                                              | tctTCGGTTTCGATAACCATCGCTGGCGATGCACCGAGCGCCAGCAAGGTATTGGCGGTaaa  <  1:1139571/62‑1 (MQ=255) tctTCGGTTTCGATAACCATCGCTGGCGATGCACCGAGCGCCAGCAAGGTATTGGCGGTaaa  <  1:178471/62‑1 (MQ=255) tctTCGGTTTCGATAACCATCGCTGGCGATGCACCGAGCGCCAGCAAGGTATTGGCGGTaaa  <  1:180325/62‑1 (MQ=255) tctTCGGTTTCGATAACCATCGCTGGCGATGCACCGAGCGCCAGCAAGGTATTGGCGGTaaa  <  1:300542/62‑1 (MQ=255) tctTCGGTTTCGATAACCATCGCTGGCGATGCACCGAGCGCCAGCAAGGTATTGGCGGTaaa  <  1:331954/62‑1 (MQ=255) tctTCGGTTTCGATAACCATCGCTGGCGATGCACCGAGCGCCAGCAAGGTATTGGCGGTaaa  <  1:581655/62‑1 (MQ=255) tctTCGGTTTCGATAACCATCGCTGGCGATGCACCGAGCGCCAGCAAGGTATTGGCGGTaaa  <  1:656094/62‑1 (MQ=255) tctTCGGTTTCGATAACCATCGCTGGCGATGCACCGAGCGCCAGCAAGGTATTGGCGGTaaa  <  1:685502/62‑1 (MQ=255) tctTCGGTTTCGATAACCATCGCTGGCGATGCACCGAGCGCCAGCAAGGTATTGGCGGTaaa  <  1:710775/62‑1 (MQ=255) tctTCGGTTTCGATAACCATCGCTGGCGATGCACCGAGCGCCAGCAAGGTATTGGCGGTaaa  <  1:859102/62‑1 (MQ=255) tctTCGGTTTCGATAACCATCGCTGGCGATGCACCGAGCGCCAGCAAGGTATTGGCGGTaaa  <  1:952448/62‑1 (MQ=255)  ctTCGGTTTCGATAACCATCGCTGGCGATGCACCGAGCGCCAGCAAGGTATTGGCGGTaaa  <  1:51100/61‑1 (MQ=255)  ctTCGGTTTCGATAACCATCGCTGGCGATGCACCGAGCGCCAGCAAGGTATTGGCGGTaaa  <  1:713095/61‑1 (MQ=255)                                                              | TCTTCGGTTTCGATAACCATCGCTGGCGATGCACCGAGCGCCAGCAAGGTATTGGCGGTAAA  >  minE/1353346‑1353407

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑