Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1380195	1380394	200	64 [0]	[0] 11	galS	DNA‑binding transcriptional repressor

AATGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATGCGC  >  minE/1380134‑1380194                                                             | aaTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:988515/61‑1 (MQ=255)  ttGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:767584/59‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGGAACATgcgc  <  1:203080/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:633504/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:464173/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:600949/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:592672/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:573187/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:566333/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:561490/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:521166/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:513601/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:508061/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:505971/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:501537/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:500601/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:1052992/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:639764/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:644999/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:675038/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:694303/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:718415/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:746315/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:779962/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:836024/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:857063/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:872396/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:891176/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:899811/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:928108/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:935274/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:170261/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:1100882/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:1114178/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:1118597/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:114462/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:1181708/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:1185591/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:122178/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:13622/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:136624/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:146529/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:155605/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:167824/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:449331/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:181910/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:184172/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:19365/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:1089592/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:200850/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:103722/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:25774/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:282851/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:292050/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:351993/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:359415/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:388152/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:401251/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:448004/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTCGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:881565/60‑1 (MQ=255)  aTGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACCTTGATGACAGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:168041/60‑1 (MQ=255)   tGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:586766/59‑1 (MQ=255)   tGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:994122/59‑1 (MQ=255)    gCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCTTTATTCAGCAACATgcgc  <  1:211579/58‑1 (MQ=255)                                                             | AATGCCGTGGCTGGAAGAAAGATAACCAATACGTTGATGACCGTTATTCAGCAACATGCGC  >  minE/1380134‑1380194

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑