Missing coverage evidence...
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GACCGTGTTGCTGCGCCAGCGGGTTGCCATCGTAAGCGACATCATGTTCAGGAAGCAGTTTG  >  minE/1411738‑1411799                                                              | gACCGTGTTGCTGCGCCAGCGGGTTGTCATCGTAAGCGACATCATGTTCAGGAAGCAGTTTg  <  1:711109/62‑1 (MQ=255) gACCGTGTTGCTGCGCCAGCGGGTTGCCATCGTAAGCGACATCATGTTCAGGAAGCAGTTTg  <  1:455654/62‑1 (MQ=255) gACCGTGTTGCTGCGCCAGCGGGTTGCCATCGTAAGCGACATCATGTTCAGGAAGCAGTTTg  <  1:95005/62‑1 (MQ=255) gACCGTGTTGCTGCGCCAGCGGGTTGCCATCGTAAGCGACATCATGTTCAGGAAGCAGTTTg  <  1:927734/62‑1 (MQ=255) gACCGTGTTGCTGCGCCAGCGGGTTGCCATCGTAAGCGACATCATGTTCAGGAAGCAGTTTg  <  1:923652/62‑1 (MQ=255) gACCGTGTTGCTGCGCCAGCGGGTTGCCATCGTAAGCGACATCATGTTCAGGAAGCAGTTTg  <  1:899538/62‑1 (MQ=255) gACCGTGTTGCTGCGCCAGCGGGTTGCCATCGTAAGCGACATCATGTTCAGGAAGCAGTTTg  <  1:859004/62‑1 (MQ=255) gACCGTGTTGCTGCGCCAGCGGGTTGCCATCGTAAGCGACATCATGTTCAGGAAGCAGTTTg  <  1:839106/62‑1 (MQ=255) gACCGTGTTGCTGCGCCAGCGGGTTGCCATCGTAAGCGACATCATGTTCAGGAAGCAGTTTg  <  1:744694/62‑1 (MQ=255) gACCGTGTTGCTGCGCCAGCGGGTTGCCATCGTAAGCGACATCATGTTCAGGAAGCAGTTTg  <  1:70344/62‑1 (MQ=255) gACCGTGTTGCTGCGCCAGCGGGTTGCCATCGTAAGCGACATCATGTTCAGGAAGCAGTTTg  <  1:69424/62‑1 (MQ=255) gACCGTGTTGCTGCGCCAGCGGGTTGCCATCGTAAGCGACATCATGTTCAGGAAGCAGTTTg  <  1:552385/62‑1 (MQ=255) gACCGTGTTGCTGCGCCAGCGGGTTGCCATCGTAAGCGACATCATGTTCAGGAAGCAGTTTg  <  1:545615/62‑1 (MQ=255) gACCGTGTTGCTGCGCCAGCGGGTTGCCATCGTAAGCGACATCATGTTCAGGAAGCAGTTTg  <  1:1012008/62‑1 (MQ=255) gACCGTGTTGCTGCGCCAGCGGGTTGCCATCGTAAGCGACATCATGTTCAGGAAGCAGTTTg  <  1:434501/62‑1 (MQ=255) gACCGTGTTGCTGCGCCAGCGGGTTGCCATCGTAAGCGACATCATGTTCAGGAAGCAGTTTg  <  1:400591/62‑1 (MQ=255) gACCGTGTTGCTGCGCCAGCGGGTTGCCATCGTAAGCGACATCATGTTCAGGAAGCAGTTTg  <  1:37374/62‑1 (MQ=255) gACCGTGTTGCTGCGCCAGCGGGTTGCCATCGTAAGCGACATCATGTTCAGGAAGCAGTTTg  <  1:352921/62‑1 (MQ=255) gACCGTGTTGCTGCGCCAGCGGGTTGCCATCGTAAGCGACATCATGTTCAGGAAGCAGTTTg  <  1:34232/62‑1 (MQ=255) gACCGTGTTGCTGCGCCAGCGGGTTGCCATCGTAAGCGACATCATGTTCAGGAAGCAGTTTg  <  1:307016/62‑1 (MQ=255) gACCGTGTTGCTGCGCCAGCGGGTTGCCATCGTAAGCGACATCATGTTCAGGAAGCAGTTTg  <  1:241493/62‑1 (MQ=255) gACCGTGTTGCTGCGCCAGCGGGTTGCCATCGTAAGCGACATCATGTTCAGGAAGCAGTTTg  <  1:202583/62‑1 (MQ=255) gACCGTGTTGCTGCGCCAGCGGGTTGCCATCGTAAGCGACATCATGTTCAGGAAGCAGTTTg  <  1:197370/62‑1 (MQ=255) gACCGTGTTGCTGCGCCAGCGGGTTGCCATCGTAAGCGACATCATGTTCAGGAAGCAGTTTg  <  1:1076475/62‑1 (MQ=255) gACCGTGTTGCTGCGCCAGCGGGTTGCCATCGTAAGCGACATCATGTTCAGGAAGCAGTTTg  <  1:105222/62‑1 (MQ=255) gACCGTGTTGCTGCGCCAGCGGGTTGCCATCGTAAGCGACATCATGTTCAGGAAGCAGTTTg  <  1:1044482/62‑1 (MQ=255) gACCATGTTGCTGCGCCAGCGGGTTGCCATCGTAAGCGACATCATGTTCAGGAAGCAGTTTg  <  1:799305/62‑1 (MQ=255)  aCCGTGTTGCTGCGCCAGCGGGTTGCCATCGTAAGCGACATCATGTTCAGGAAGCAGTTTg  <  1:306481/61‑1 (MQ=255)                                                              | GACCGTGTTGCTGCGCCAGCGGGTTGCCATCGTAAGCGACATCATGTTCAGGAAGCAGTTTG  >  minE/1411738‑1411799

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑