Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1441346	1441445	100	30 [0]	[0] 5	rcsD	phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC

CCTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTG  >  minE/1441284‑1441345                                                              | ccTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTTCTATCTg  <  1:374300/62‑1 (MQ=255) ccTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTg  <  1:496601/62‑1 (MQ=255) ccTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTg  <  1:916058/62‑1 (MQ=255) ccTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTg  <  1:881738/62‑1 (MQ=255) ccTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTg  <  1:860776/62‑1 (MQ=255) ccTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTg  <  1:840670/62‑1 (MQ=255) ccTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTg  <  1:819778/62‑1 (MQ=255) ccTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTg  <  1:767260/62‑1 (MQ=255) ccTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTg  <  1:695074/62‑1 (MQ=255) ccTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTg  <  1:605576/62‑1 (MQ=255) ccTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTg  <  1:589142/62‑1 (MQ=255) ccTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTg  <  1:554092/62‑1 (MQ=255) ccTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTg  <  1:553022/62‑1 (MQ=255) ccTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTg  <  1:544049/62‑1 (MQ=255) ccTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTg  <  1:519110/62‑1 (MQ=255) ccTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTg  <  1:506325/62‑1 (MQ=255) ccTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTg  <  1:1025473/62‑1 (MQ=255) ccTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTg  <  1:429843/62‑1 (MQ=255) ccTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTg  <  1:319220/62‑1 (MQ=255) ccTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTg  <  1:224356/62‑1 (MQ=255) ccTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTg  <  1:191261/62‑1 (MQ=255) ccTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTg  <  1:183228/62‑1 (MQ=255) ccTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTg  <  1:137692/62‑1 (MQ=255) ccTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTg  <  1:123378/62‑1 (MQ=255) ccTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTg  <  1:1171574/62‑1 (MQ=255) ccTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTg  <  1:1169705/62‑1 (MQ=255) ccTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTg  <  1:1150301/62‑1 (MQ=255) ccTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTg  <  1:1115967/62‑1 (MQ=255) ccTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTg  <  1:1107148/62‑1 (MQ=255)                         tACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTg  <  1:343963/38‑1 (MQ=255)                                                              | CCTCCCCCTCCTCCGGCGAAGGTTTACAAGAGACGCGCCTGAAACAGGATGTCTACTATCTG  >  minE/1441284‑1441345

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑