Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1443088	1443096	9	24 [0]	[0] 20	rcsD	phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC

GATGGGCTTGGTACACGCTACTCTGTGCATATCAAAATGCTCGCAGCTGACCCGGAAGT  >  minE/1443029‑1443087                                                           | gATGGGCTTGGTACACGCTACTCTGTGCATATCAAAATGCTCGCAGCTGACCCGGAAGt  >  1:470087/1‑59 (MQ=255) gATGGGCTTGGTACACGCTACTCTGTGCATATCAAAATGCTCGCAGCTGACCCGGAAGt  >  1:970378/1‑59 (MQ=255) gATGGGCTTGGTACACGCTACTCTGTGCATATCAAAATGCTCGCAGCTGACCCGGAAGt  >  1:966582/1‑59 (MQ=255) gATGGGCTTGGTACACGCTACTCTGTGCATATCAAAATGCTCGCAGCTGACCCGGAAGt  >  1:820014/1‑59 (MQ=255) gATGGGCTTGGTACACGCTACTCTGTGCATATCAAAATGCTCGCAGCTGACCCGGAAGt  >  1:796021/1‑59 (MQ=255) gATGGGCTTGGTACACGCTACTCTGTGCATATCAAAATGCTCGCAGCTGACCCGGAAGt  >  1:785080/1‑59 (MQ=255) gATGGGCTTGGTACACGCTACTCTGTGCATATCAAAATGCTCGCAGCTGACCCGGAAGt  >  1:687280/1‑59 (MQ=255) gATGGGCTTGGTACACGCTACTCTGTGCATATCAAAATGCTCGCAGCTGACCCGGAAGt  >  1:653736/1‑59 (MQ=255) gATGGGCTTGGTACACGCTACTCTGTGCATATCAAAATGCTCGCAGCTGACCCGGAAGt  >  1:579818/1‑59 (MQ=255) gATGGGCTTGGTACACGCTACTCTGTGCATATCAAAATGCTCGCAGCTGACCCGGAAGt  >  1:54396/1‑59 (MQ=255) gATGGGCTTGGTACACGCTACTCTGTGCATATCAAAATGCTCGCAGCTGACCCGGAAGt  >  1:520326/1‑59 (MQ=255) gATGGGCTTGGTACACGCTACTCTGTGCATATCAAAATGCTCGCAGCTGACCCGGAAGt  >  1:1027866/1‑59 (MQ=255) gATGGGCTTGGTACACGCTACTCTGTGCATATCAAAATGCTCGCAGCTGACCCGGAAGt  >  1:421628/1‑59 (MQ=255) gATGGGCTTGGTACACGCTACTCTGTGCATATCAAAATGCTCGCAGCTGACCCGGAAGt  >  1:416315/1‑59 (MQ=255) gATGGGCTTGGTACACGCTACTCTGTGCATATCAAAATGCTCGCAGCTGACCCGGAAGt  >  1:303281/1‑59 (MQ=255) gATGGGCTTGGTACACGCTACTCTGTGCATATCAAAATGCTCGCAGCTGACCCGGAAGt  >  1:265347/1‑59 (MQ=255) gATGGGCTTGGTACACGCTACTCTGTGCATATCAAAATGCTCGCAGCTGACCCGGAAGt  >  1:254314/1‑59 (MQ=255) gATGGGCTTGGTACACGCTACTCTGTGCATATCAAAATGCTCGCAGCTGACCCGGAAGt  >  1:215554/1‑59 (MQ=255) gATGGGCTTGGTACACGCTACTCTGTGCATATCAAAATGCTCGCAGCTGACCCGGAAGt  >  1:1149232/1‑59 (MQ=255) gATGGGCTTGGTACACGCTACTCTGTGCATATCAAAATGCTCGCAGCTGACCCGGAAGt  >  1:1129971/1‑59 (MQ=255) gATGGGCTTGGTACACGCTACTCTGTGCATATCAAAATGCTCGCAGCTGACCCGGAAGt  >  1:1077533/1‑59 (MQ=255) gATGGGCTTGGTACACGCTACTCTGTGCATATCAAAATGCTCGCAGCTGACCCGGAAGt  >  1:1054766/1‑59 (MQ=255) gATGGGCTTGGTACACGCTACTCTGTGCATATCAAAATGCTCGCAGCTGACCCGGAAGt  >  1:1029/1‑59 (MQ=255) gATGGGCTTGGTACACGCTACTCTGTGCATAACAAAATGCTCGCAGCTGACCCGGAAGt  >  1:55450/1‑59 (MQ=255)                                                           | GATGGGCTTGGTACACGCTACTCTGTGCATATCAAAATGCTCGCAGCTGACCCGGAAGT  >  minE/1443029‑1443087

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑