Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1471206	1471371	166	59 [0]	[0] 18	yfaL	adhesin

TGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGCC  >  minE/1471144‑1471205                                                              | tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:782383/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:36159/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:382091/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:432121/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:48444/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:490234/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:513719/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:587665/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:620183/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:628962/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:632153/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:753804/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:765749/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:774146/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:1007324/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:784850/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:802907/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:825492/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:832273/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:843614/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:869992/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:872368/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:87612/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:968728/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:971640/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:996994/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:998323/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:999184/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:176762/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:1004068/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:1020336/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:1026436/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:1111412/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:1121657/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:1136612/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:1187198/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:1200687/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:124833/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:148559/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:163380/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:175705/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:340099/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:210264/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:219079/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:26729/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:267892/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:191041/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:334617/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:282211/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:312831/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:282981/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:301821/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:300979/62‑1 (MQ=255) tGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTACTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:297993/62‑1 (MQ=255) cggTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:350449/61‑1 (MQ=255)  ggTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:1156494/61‑1 (MQ=255)   gttgttATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:614405/60‑1 (MQ=255)        tATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:1200869/55‑1 (MQ=255)                   aCATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGcc  <  1:854782/44‑1 (MQ=255)                                                              | TGGTTGTTATCAAAAATAACATCACTTAAATAAACGTCATTATTAATGGTATAAATTGCGCC  >  minE/1471144‑1471205

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑