Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1489576	1489605	30	40 [0]	[1] 70	nuoL	NADH:ubiquinone oxidoreductase, membrane subunit L

GCAGAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTGC  >  minE/1489514‑1489575                                                              | gctgAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:942805/59‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:799720/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:1006578/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:613628/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:64779/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:669206/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:702320/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:754079/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:772947/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:786189/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:786725/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:531265/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:817821/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:871722/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:881186/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:897760/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:901887/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:964130/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:971773/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:181017/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:985169/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:111474/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:1126648/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:1128510/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:1129688/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:1135570/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:1136804/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:1148807/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:1202945/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:190755/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:195949/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:352898/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:416294/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:436958/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:983735/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:486352/62‑1 (MQ=255) gcagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:49028/62‑1 (MQ=255)  cagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCATCATGCTGCCGTgc  <  1:535806/61‑1 (MQ=255)  cagAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:485897/61‑1 (MQ=255)                            cAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTgc  <  1:1082586/35‑1 (MQ=255)                                                              | GCAGAATGCCGACCACCGCGACCACGCCAGAGGTAATTTCCAGGGTCAACATGCTGCCGTGC  >  minE/1489514‑1489575

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑