Missing coverage evidence...
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CTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACA  >  minE/1498000‑1498060                                                             | cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:630023/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:367387/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:376926/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:410193/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:41921/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:447655/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:448184/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:47521/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:492396/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:520829/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:355506/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:733986/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:815447/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:822028/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:838121/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:877532/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:93041/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:942591/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:954773/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:986516/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:351130/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:106550/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:1077426/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:1103207/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:1134501/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:117518/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:121950/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:145786/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:149383/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:188836/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:198747/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:263051/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:298632/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:299722/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:315874/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:328124/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:104691/61‑1 (MQ=255) cTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGGTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:107009/61‑1 (MQ=255)                        gttgATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACa  <  1:187603/38‑1 (MQ=255)                                                             | CTCAAAAGCCTCGGTTTGTGGTTGTTGATTCTCGTGCATAATTAGCGGTCCACATCTGACA  >  minE/1498000‑1498060

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑