Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1520199	1520283	85	3 [0]	[0] 21	truA	pseudouridylate synthase I

TCCACCGCGACCAGATACAGCCCTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCCGCCAGCGTTCTGTCCTT  >  minE/1520137‑1520198                                                              | tCCACCGCGACCAGATACAGCCCTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCCGCCAGCGTTCTGTCCtt  >  1:1067123/1‑62 (MQ=255) tCCACCGCGACCAGATACAGCCCTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCCGCCAGCGTTCTGTCCtt  >  1:406232/1‑62 (MQ=255) tCCACCGCGACCAGATACAGCCCTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCCGCCAGCGTTCTGTCCtt  >  1:519537/1‑62 (MQ=255)                                                              | TCCACCGCGACCAGATACAGCCCTTCCGCTTTTGCCGTTGCTGCCGCCAGCGTTCTGTCCTT  >  minE/1520137‑1520198

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑