Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1538948	1538961	14	49 [0]	[0] 5	yfcU	predicted export usher protein

ACCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTAA  >  minE/1538886‑1538947                                                              | aCCTTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:666859/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:77050/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:567872/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:582021/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:586515/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:587678/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:658398/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:696870/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:717064/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:717850/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:739430/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:571677/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:771846/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:828744/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:849697/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:872593/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:876146/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:92419/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:93800/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:94365/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:953707/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:974458/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:278419/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:1042688/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:1117312/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:1143831/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:1181761/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:1202613/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:192828/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:209066/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:246253/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:256894/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:258830/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:560820/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:372162/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:372688/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:402859/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:414815/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:480406/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:485898/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:508212/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:522540/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:543318/62‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:558069/62‑1 (MQ=255)  ccGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:792959/61‑1 (MQ=255)  ccGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:691675/61‑1 (MQ=255)  ccGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:914823/61‑1 (MQ=255)       cAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:1009547/56‑1 (MQ=255)                            ggTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTaa  <  1:939223/35‑1 (MQ=255)                                                              | ACCGTCCAGCGAACCTTTGCCATAAGCGGTGTCTTTATCCAGTTTGGTATGCGAATGAGTAA  >  minE/1538886‑1538947

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑