Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1561369	1561395	27	23 [0]	[0] 19	evgS	hybrid sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with EvgA

CGCTGCATTTCACAAGGTTAAGGAAGGTGAACTTGATGCTCTGGTCGCGACACAGCTAAATT  >  minE/1561307‑1561368                                                              | cgcTGCATTTCACAAGGTTAAGGAAGGTGAACTTGATGCTCTGGTCGCGACACAGCTAAAtt  <  1:522896/62‑1 (MQ=255) cgcTGCATTTCACAAGGTTAAGGAAGGTGAACTTGATGCTCTGGTCGCGACACAGCTAAAtt  <  1:888547/62‑1 (MQ=255) cgcTGCATTTCACAAGGTTAAGGAAGGTGAACTTGATGCTCTGGTCGCGACACAGCTAAAtt  <  1:880303/62‑1 (MQ=255) cgcTGCATTTCACAAGGTTAAGGAAGGTGAACTTGATGCTCTGGTCGCGACACAGCTAAAtt  <  1:80112/62‑1 (MQ=255) cgcTGCATTTCACAAGGTTAAGGAAGGTGAACTTGATGCTCTGGTCGCGACACAGCTAAAtt  <  1:777486/62‑1 (MQ=255) cgcTGCATTTCACAAGGTTAAGGAAGGTGAACTTGATGCTCTGGTCGCGACACAGCTAAAtt  <  1:720805/62‑1 (MQ=255) cgcTGCATTTCACAAGGTTAAGGAAGGTGAACTTGATGCTCTGGTCGCGACACAGCTAAAtt  <  1:712896/62‑1 (MQ=255) cgcTGCATTTCACAAGGTTAAGGAAGGTGAACTTGATGCTCTGGTCGCGACACAGCTAAAtt  <  1:648777/62‑1 (MQ=255) cgcTGCATTTCACAAGGTTAAGGAAGGTGAACTTGATGCTCTGGTCGCGACACAGCTAAAtt  <  1:62558/62‑1 (MQ=255) cgcTGCATTTCACAAGGTTAAGGAAGGTGAACTTGATGCTCTGGTCGCGACACAGCTAAAtt  <  1:612745/62‑1 (MQ=255) cgcTGCATTTCACAAGGTTAAGGAAGGTGAACTTGATGCTCTGGTCGCGACACAGCTAAAtt  <  1:578200/62‑1 (MQ=255) cgcTGCATTTCACAAGGTTAAGGAAGGTGAACTTGATGCTCTGGTCGCGACACAGCTAAAtt  <  1:543762/62‑1 (MQ=255) cgcTGCATTTCACAAGGTTAAGGAAGGTGAACTTGATGCTCTGGTCGCGACACAGCTAAAtt  <  1:1101559/62‑1 (MQ=255) cgcTGCATTTCACAAGGTTAAGGAAGGTGAACTTGATGCTCTGGTCGCGACACAGCTAAAtt  <  1:5179/62‑1 (MQ=255) cgcTGCATTTCACAAGGTTAAGGAAGGTGAACTTGATGCTCTGGTCGCGACACAGCTAAAtt  <  1:479448/62‑1 (MQ=255) cgcTGCATTTCACAAGGTTAAGGAAGGTGAACTTGATGCTCTGGTCGCGACACAGCTAAAtt  <  1:448403/62‑1 (MQ=255) cgcTGCATTTCACAAGGTTAAGGAAGGTGAACTTGATGCTCTGGTCGCGACACAGCTAAAtt  <  1:360780/62‑1 (MQ=255) cgcTGCATTTCACAAGGTTAAGGAAGGTGAACTTGATGCTCTGGTCGCGACACAGCTAAAtt  <  1:355364/62‑1 (MQ=255) cgcTGCATTTCACAAGGTTAAGGAAGGTGAACTTGATGCTCTGGTCGCGACACAGCTAAAtt  <  1:351958/62‑1 (MQ=255) cgcTGCATTTCACAAGGTTAAGGAAGGTGAACTTGATGCTCTGGTCGCGACACAGCTAAAtt  <  1:347015/62‑1 (MQ=255) cgcTGCATTTCACAAGGTTAAGGAAGGTGAACTTGATGCTCTGGTCGCGACACAGCTAAAtt  <  1:320228/62‑1 (MQ=255) cgcTGCATTTCACAAGGTTAAGGAAGGTGAACTTGATGCTCTGGTCGCGACACAGCTAAAtt  <  1:216361/62‑1 (MQ=255) cgcTGCATTTCACAAGGTTAAGGAAGGTGAACTTGATGCTCTGGTCGCGACACAGCTAAAtt  <  1:1155802/62‑1 (MQ=255)                                                              | CGCTGCATTTCACAAGGTTAAGGAAGGTGAACTTGATGCTCTGGTCGCGACACAGCTAAATT  >  minE/1561307‑1561368

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑