Missing coverage evidence...
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GTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATG  >  minE/1575931‑1575991                                                             | gTAATCTACTGCCATGCGACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:286328/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCACCCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:192899/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCTACACCATTTACCATg  >  1:1044118/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:820018/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:591076/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:592724/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:617145/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:626995/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:6478/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:752272/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:781396/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:801956/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:808353/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:468776/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:833927/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:849926/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:870129/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:892109/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:898627/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:907645/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:95845/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:990298/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:992395/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:276041/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:1084265/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:1196306/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:136482/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:146294/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:147077/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:185590/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:192898/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:237477/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:252981/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:520567/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:333763/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:334350/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:355738/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:362719/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:371224/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:401088/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:430697/1‑61 (MQ=255) gTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATg  >  1:464119/1‑61 (MQ=255)                                                             | GTAATCTACTGCCATGCCACTCAGAATCGAGCCAACCCATGCGCCGACACCATTTACCATG  >  minE/1575931‑1575991

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑