Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1634391	1634571	181	61 [0]	[0] 17	acrD	aminoglycoside/multidrug efflux system

TTCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAT  >  minE/1634347‑1634390                                            | ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:724594/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:423565/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:433208/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:438567/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:490384/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:515858/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:533391/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:541876/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:546643/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:55509/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:624252/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:631350/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:634727/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:658026/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:66965/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:416988/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:726771/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:730231/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:732064/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:801938/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:84075/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:856380/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:867957/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:872082/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:886906/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:918079/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:926283/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:937492/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:938955/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:997423/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:173890/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:102280/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:1029617/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:1038208/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:1044197/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:1064751/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:1066982/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:1105112/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:1116418/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:1136091/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:1172597/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:1201245/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:124406/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:137827/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:151635/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:151757/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:1017794/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:180728/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:184912/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:203535/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:203930/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:225760/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:25436/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:275790/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:291899/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:350641/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:357625/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:368534/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:393438/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGAGGATATCGAt  >  1:440571/1‑44 (MQ=255) ttCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATCGCGTCGGGGATATCGAt  >  1:306488/1‑44 (MQ=255)                                            | TTCAGGACCCGTTAAGCCGCGTGAATGGCGTCGGGGATATCGAT  >  minE/1634347‑1634390

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑