Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1636262	1636316	55	43 [0]	[0] 31	acrD	aminoglycoside/multidrug efflux system

CTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTC  >  minE/1636200‑1636261                                                              | ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:606313/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:251309/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:284330/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:286326/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:328230/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:331167/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:349865/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:371808/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:418277/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:445755/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:576186/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:241190/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:610218/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:620745/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:623324/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:641964/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:645707/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:677528/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:785976/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:80091/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:812622/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:846644/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:139330/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:1022925/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:1038249/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:1068989/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:1115055/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:1134228/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:1142852/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:1145562/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:1155437/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:1165161/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:1018751/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:157814/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:175601/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:179207/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:182448/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:21463/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:219819/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:226235/62‑1 (MQ=255) ctgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:23640/62‑1 (MQ=255)  tgcCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:1035335/61‑1 (MQ=255)             aTCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTtctc  <  1:163218/50‑1 (MQ=255)                                                              | CTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTC  >  minE/1636200‑1636261

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑