Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1653710	1653879	170	74 [0]	[0] 46	upp/purM	uracil phosphoribosyltransferase/phosphoribosylaminoimidazole synthetase

TGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGAT  >  minE/1653667‑1653709                                           | tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:722277/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:84226/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:831858/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:831852/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:831144/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:754680/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:744275/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:738071/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:735792/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:728252/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:843884/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:72168/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:69380/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:692058/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:685314/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:651907/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:623638/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:59316/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:1005122/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:918560/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:98220/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:977853/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:972302/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:970476/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:945691/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:943674/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:928727/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:922958/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:552732/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:917500/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:914713/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:914673/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:890857/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:890529/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:879740/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:867745/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:848670/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:115005/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:520367/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:1566/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:153388/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:140324/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:134594/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:1179688/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:1176085/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:1152761/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:178595/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:1121315/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:11176/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:1082149/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:1079766/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:1068052/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:1040743/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:1027412/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:1023980/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:314480/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:515299/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:467439/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:46157/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:458143/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:45239/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:442937/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:422541/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:38018/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:202780/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:301503/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:272769/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:248296/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:246980/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:243267/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:207733/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGTTATTCTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:873312/1‑43 (MQ=255) tGAGATAAAGATATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:1125409/1‑43 (MQ=255)  gagaTAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGat  >  1:225872/1‑42 (MQ=255)                                           | TGAGATAAAGTTATTTTATATTCAGATGGTTATGAAAGAAGAT  >  minE/1653667‑1653709

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑