Missing coverage evidence...
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AAAACGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGAA  >  minE/1654856‑1654917                                                              | aaatCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:320695/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:676499/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:466106/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:512558/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:580280/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:601899/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:604964/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:608442/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:619304/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:634329/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:1094982/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:691812/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:739036/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:75244/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:783315/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:800226/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:813979/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:861864/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:890999/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:999325/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:18931/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:1074977/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:1101073/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:1111682/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:1113625/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:111478/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:1118134/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:1119552/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:16888/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:429500/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:200121/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:239729/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:304444/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:317989/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:350230/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:399932/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:404566/62‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:419387/62‑1 (MQ=255)  aaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:323419/61‑1 (MQ=255)  aaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:507114/61‑1 (MQ=255)  aaaCGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:958605/61‑1 (MQ=255)   aaCGCGTTGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:98138/60‑1 (MQ=255)              aaTCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:606450/49‑1 (MQ=255)                            aaGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGaa  <  1:961650/35‑1 (MQ=255)                                                              | AAAACGCGTGGAAAATCGGTATCATCAAAGCCTCTGATTCCGAACAACGCGTGGTTATCGAA  >  minE/1654856‑1654917

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑