Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1716722	1716743	22	55 [0]	[0] 2	[yphH]	[yphH]

TTGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAG  >  minE/1716660‑1716721                                                              | ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:613252/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:376734/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:37761/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:379837/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:385883/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:391484/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:426433/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:43039/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:520722/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:555666/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:595968/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:1025000/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:626867/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:638257/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:686532/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:691591/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:701939/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:721019/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:784194/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:825519/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:956067/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:971564/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:329429/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:1011747/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:1036747/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:103952/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:1102027/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:1105632/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:1139260/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:1187688/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:1191697/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:132354/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:162217/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:165593/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:177625/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:273999/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:273498/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:26008/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:330374/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:244903/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:22273/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:219989/62‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:201730/62‑1 (MQ=255)  tGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:233183/61‑1 (MQ=255)  tGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:416556/61‑1 (MQ=255)  tGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:618795/61‑1 (MQ=255)  tGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:881583/61‑1 (MQ=255)  tGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:895878/61‑1 (MQ=255)  tGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:898246/61‑1 (MQ=255)  tGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:94614/61‑1 (MQ=255)   ggCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:398244/60‑1 (MQ=255)   ggCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:707346/60‑1 (MQ=255)   ggCTTTGGGCAATTAAGCCGAGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:599301/60‑1 (MQ=255)                 aaGCCGCGCACAACGGGTGCTGGTAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:774871/46‑1 (MQ=39)                        gcACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAg  <  1:98383/39‑1 (MQ=255)                                                              | TTGGCTTTGGGCAATTAAGCCGCGCACAACAGGTGCTGGGAATTGGCTATTTGTATGTTGAG  >  minE/1716660‑1716721

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑