Missing coverage evidence...
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TTAGCCACGCGCTTCCAGCATCAGACGCTTCATTTCTGCCACCGCATCTTTCAGTCCGGTC  >  minE/1733684‑1733744                                                             | ttAGCCACGCGCTTCCAGCATCAGCCGCTTCATTTCTGCCACCGCATCTTTCAGTCCGGtc  >  1:173478/1‑61 (MQ=255) ttAGCCACGCGCTTCCAGCATCAGACGCTTCATTTCTGCCCCCGCATCTTTCAGTCCGGtc  >  1:546025/1‑61 (MQ=255) ttAGCCACGCGCTTCCAGCATCAGACGCTTCATTTCTGCCACCTCATCTTTCAGTCCGGtc  >  1:162014/1‑61 (MQ=255) ttAGCCACGCGCTTCCAGCATCAGACGCTTCATTTCTGCCACCGCATCTTTCAGTCCGGtc  >  1:752734/1‑61 (MQ=255) ttAGCCACGCGCTTCCAGCATCAGACGCTTCATTTCTGCCACCGCATCTTTCAGTCCGGtc  >  1:801255/1‑61 (MQ=255) ttAGCCACGCGCTTCCAGCATCAGACGCTTCATTTCTGCCACCGCATCTTTCAGTCCGGtc  >  1:751072/1‑61 (MQ=255) ttAGCCACGCGCTTCCAGCATCAGACGCTTCATTTCTGCCACCGCATCTTTCAGTCCGGtc  >  1:747641/1‑61 (MQ=255) ttAGCCACGCGCTTCCAGCATCAGACGCTTCATTTCTGCCACCGCATCTTTCAGTCCGGtc  >  1:695166/1‑61 (MQ=255) ttAGCCACGCGCTTCCAGCATCAGACGCTTCATTTCTGCCACCGCATCTTTCAGTCCGGtc  >  1:642870/1‑61 (MQ=255) 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TTAGCCACGCGCTTCCAGCATCAGACGCTTCATTTCTGCCACCGCATCTTTCAGTCCGGTC  >  minE/1733684‑1733744

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑