Missing coverage evidence...
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ACTATCTACCCACCACAAAAAGATGTCTTTAACGCGTTCCGCTTTACAGAGTTGGGTGACGT  >  minE/1749545‑1749606                                                              | aCTATCTACCCACCACAAAAAGATGTCTTTAACGCGTTCCGCTTTACAGAGTTGGGTGACGt  <  1:1011488/62‑1 (MQ=255) aCTATCTACCCACCACAAAAAGATGTCTTTAACGCGTTCCGCTTTACAGAGTTGGGTGACGt  <  1:994481/62‑1 (MQ=255) aCTATCTACCCACCACAAAAAGATGTCTTTAACGCGTTCCGCTTTACAGAGTTGGGTGACGt  <  1:95884/62‑1 (MQ=255) aCTATCTACCCACCACAAAAAGATGTCTTTAACGCGTTCCGCTTTACAGAGTTGGGTGACGt  <  1:92990/62‑1 (MQ=255) aCTATCTACCCACCACAAAAAGATGTCTTTAACGCGTTCCGCTTTACAGAGTTGGGTGACGt  <  1:787506/62‑1 (MQ=255) aCTATCTACCCACCACAAAAAGATGTCTTTAACGCGTTCCGCTTTACAGAGTTGGGTGACGt  <  1:74930/62‑1 (MQ=255) aCTATCTACCCACCACAAAAAGATGTCTTTAACGCGTTCCGCTTTACAGAGTTGGGTGACGt  <  1:632109/62‑1 (MQ=255) aCTATCTACCCACCACAAAAAGATGTCTTTAACGCGTTCCGCTTTACAGAGTTGGGTGACGt  <  1:629006/62‑1 (MQ=255) aCTATCTACCCACCACAAAAAGATGTCTTTAACGCGTTCCGCTTTACAGAGTTGGGTGACGt  <  1:593681/62‑1 (MQ=255) aCTATCTACCCACCACAAAAAGATGTCTTTAACGCGTTCCGCTTTACAGAGTTGGGTGACGt  <  1:456967/62‑1 (MQ=255) aCTATCTACCCACCACAAAAAGATGTCTTTAACGCGTTCCGCTTTACAGAGTTGGGTGACGt  <  1:423626/62‑1 (MQ=255) aCTATCTACCCACCACAAAAAGATGTCTTTAACGCGTTCCGCTTTACAGAGTTGGGTGACGt  <  1:238515/62‑1 (MQ=255) aCTATCTACCCACCACAAAAAGATGTCTTTAACGCGTTCCGCTTTACAGAGTTGGGTGACGt  <  1:215993/62‑1 (MQ=255) aCTATCTACCCACCACAAAAAGATGTCTTTAACGCGTTCCGCTTTACAGAGTTGGGTGACGt  <  1:183461/62‑1 (MQ=255) aCTATCTACCCACCACAAAAAGATGTCTTTAACGCGTTCCGCTTTACAGAGTTGGGTGACGt  <  1:1074871/62‑1 (MQ=255) aCTATCTACCCACCACAAAAAGATGTCTTTAACGCGTTCCGCTTTACAGAGTTGGGTGACGt  <  1:102272/62‑1 (MQ=255) aCTATCTACCCACCACAAAAAGATGTCTTTAACGCGTTCCGCTTTACAGAGTTGGGTGACGt  <  1:1004973/62‑1 (MQ=255)   tATCTACCCACCACAAAAAGATGTCTTTAACGCGTTCCGCTTTACAGAGTTGGGTGACGt  <  1:578463/60‑1 (MQ=255)                                                              | ACTATCTACCCACCACAAAAAGATGTCTTTAACGCGTTCCGCTTTACAGAGTTGGGTGACGT  >  minE/1749545‑1749606

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑