Missing coverage evidence...
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ATACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAATT  >  minE/1787358‑1787418                                                             | aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGTTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:283706/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:82183/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:646788/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:664811/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:67121/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:680741/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:683607/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:747828/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:780306/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:80087/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:821400/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:476371/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:834364/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:851306/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:852008/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:858927/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:902005/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:933404/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:974608/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:976257/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:99644/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:224693/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:1091589/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:1102158/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:1116965/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:1170909/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:1176046/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:148146/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:169119/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:176317/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:1083248/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:22684/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:247278/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:269959/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:320332/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:353044/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:395345/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:411722/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:48759/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTACGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:1054813/1‑61 (MQ=255) aTACATTTGATCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAAtt  >  1:213864/1‑61 (MQ=255)                                                             | ATACATTTGCTCCGCGCTGTAGGGTACCAGTGCGGTCCGGCTAATCTGAGGCATAACAATT  >  minE/1787358‑1787418

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑