Missing coverage evidence...
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CCTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGATTTCAGATTACCGATGATTCACGAC  >  minE/1787516‑1787577                                                              | cgttGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGATTTCAGATTACCGATGATTCacgac  <  1:546897/60‑1 (MQ=255) ccTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGATTTCAGATTACCGATGATTCacgac  <  1:422064/62‑1 (MQ=255) ccTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGATTTCAGATTACCGATGATTCacgac  <  1:828365/62‑1 (MQ=255) ccTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGATTTCAGATTACCGATGATTCacgac  <  1:800511/62‑1 (MQ=255) ccTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGATTTCAGATTACCGATGATTCacgac  <  1:766003/62‑1 (MQ=255) ccTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGATTTCAGATTACCGATGATTCacgac  <  1:688376/62‑1 (MQ=255) ccTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGATTTCAGATTACCGATGATTCacgac  <  1:681922/62‑1 (MQ=255) ccTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGATTTCAGATTACCGATGATTCacgac  <  1:524588/62‑1 (MQ=255) ccTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGATTTCAGATTACCGATGATTCacgac  <  1:495459/62‑1 (MQ=255) ccTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGATTTCAGATTACCGATGATTCacgac  <  1:463412/62‑1 (MQ=255) ccTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGATTTCAGATTACCGATGATTCacgac  <  1:365387/62‑1 (MQ=255) ccTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGATTTCAGATTACCGATGATTCacgac  <  1:335422/62‑1 (MQ=255) ccTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGATTTCAGATTACCGATGATTCacgac  <  1:1176600/62‑1 (MQ=255) ccTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGATTTCAGATTACCGATGATTCacgac  <  1:1166656/62‑1 (MQ=255) ccTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGATTTCAGATTACCGATGATTCacgac  <  1:1105529/62‑1 (MQ=255) ccTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGATTTCAGATTACCGATGATTAacgac  <  1:1184341/62‑1 (MQ=255)  gttGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGATTTCAGATTACCGATGATTCacgac  <  1:632450/60‑1 (MQ=255)  cTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGATTTCAGATTACCGATGATTCacgac  <  1:16733/61‑1 (MQ=255)  cTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGATTTCAGATTACCGATGATTCacgac  <  1:138993/61‑1 (MQ=255)  cTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGATTTCAGATTACCGATGATTCacgac  <  1:1202951/61‑1 (MQ=255)  cTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGATTTCAGATTACCGATGATTCacgac  <  1:1168401/61‑1 (MQ=255)        ccccGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGATTCCAGATTACCGATGATTCacgac  <  1:1081033/55‑1 (MQ=255)                                                              | CCTTGTCCCCCGCAGGATTGATATGGGGTGTTTTCGATTTCAGATTACCGATGATTCACGAC  >  minE/1787516‑1787577

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑