Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	139600	139676	77	25 [0]	[0] 3	htrE	predicted outer membrane usher protein

CACCTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGT  >  minE/139539‑139599                                                             | cACCTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGt  >  1:444819/1‑61 (MQ=255) cACCTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGt  >  1:964650/1‑61 (MQ=255) cACCTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGt  >  1:93152/1‑61 (MQ=255) cACCTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGt  >  1:811364/1‑61 (MQ=255) cACCTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGt  >  1:773948/1‑61 (MQ=255) cACCTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGt  >  1:740686/1‑61 (MQ=255) cACCTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGt  >  1:721896/1‑61 (MQ=255) cACCTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGt  >  1:675265/1‑61 (MQ=255) cACCTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGt  >  1:674930/1‑61 (MQ=255) cACCTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGt  >  1:662304/1‑61 (MQ=255) cACCTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGt  >  1:585963/1‑61 (MQ=255) cACCTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGt  >  1:578888/1‑61 (MQ=255) cACCTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGt  >  1:1083311/1‑61 (MQ=255) cACCTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGt  >  1:41993/1‑61 (MQ=255) cACCTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGt  >  1:371658/1‑61 (MQ=255) cACCTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGt  >  1:363268/1‑61 (MQ=255) cACCTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGt  >  1:296282/1‑61 (MQ=255) cACCTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGt  >  1:284415/1‑61 (MQ=255) cACCTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGt  >  1:272052/1‑61 (MQ=255) cACCTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGt  >  1:253990/1‑61 (MQ=255) cACCTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGt  >  1:13332/1‑61 (MQ=255) cACCTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGt  >  1:1192164/1‑61 (MQ=255) cACCTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGt  >  1:1125807/1‑61 (MQ=255) cACCTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGt  >  1:112035/1‑61 (MQ=255) cACCTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACAAGGGGt  >  1:923874/1‑61 (MQ=255)                                                             | CACCTAAATTCATCCCACCGTTAAATGCAGCATAAATGCTTTCATTTTTTCGACCAGGGGT  >  minE/139539‑139599

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑