Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	140275	140318	44	46 [0]	[0] 35	ecpD	predicted periplasmic pilin chaperone

GCCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCG  >  minE/140228‑140274                                               | gcCAGCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:188598/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:467008/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:466914/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:479766/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:49467/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:512318/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:555389/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:581998/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:61040/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:625797/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:641828/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:668906/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:684481/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:725767/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:754385/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:823571/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:83159/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:836099/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:841036/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:851076/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:866499/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:876555/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:940636/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:973656/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:183702/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:1033249/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:1104861/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:1111242/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:1147629/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:1157748/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:1158112/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:1172346/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:1176471/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:1184542/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:126659/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:1024040/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:235484/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:274468/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:2801/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:315631/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:359277/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:384779/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:400202/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:41448/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:419084/47‑1 (MQ=255) gcCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCg  <  1:452214/47‑1 (MQ=255)                                               | GCCACCAAAGTCATTAATGGCGTAAAAATGCACTTTTGCAGAATTCG  >  minE/140228‑140274

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑