Missing coverage evidence...
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ATCCTGACGCCGTTCAGCCGCCTGGTAACACCGAAAATTACCGAGATCCTGGGCTTTAACTT  >  minE/1821285‑1821346                                                              | atCCTGACGCCGTTCAGCCGCCTGGTAACACCGGAAATTACCGAGATCCTGGGCTTTAACtt  <  1:906024/62‑1 (MQ=255) atCCTGACGCCGTTCAGCCGCCTGGTAACACCGAAAATTACCGAGATCCTGGGCTTTAACtt  <  1:476030/62‑1 (MQ=255) atCCTGACGCCGTTCAGCCGCCTGGTAACACCGAAAATTACCGAGATCCTGGGCTTTAACtt  <  1:929481/62‑1 (MQ=255) atCCTGACGCCGTTCAGCCGCCTGGTAACACCGAAAATTACCGAGATCCTGGGCTTTAACtt  <  1:907971/62‑1 (MQ=255) atCCTGACGCCGTTCAGCCGCCTGGTAACACCGAAAATTACCGAGATCCTGGGCTTTAACtt  <  1:895833/62‑1 (MQ=255) atCCTGACGCCGTTCAGCCGCCTGGTAACACCGAAAATTACCGAGATCCTGGGCTTTAACtt  <  1:868257/62‑1 (MQ=255) atCCTGACGCCGTTCAGCCGCCTGGTAACACCGAAAATTACCGAGATCCTGGGCTTTAACtt  <  1:855762/62‑1 (MQ=255) atCCTGACGCCGTTCAGCCGCCTGGTAACACCGAAAATTACCGAGATCCTGGGCTTTAACtt  <  1:702828/62‑1 (MQ=255) atCCTGACGCCGTTCAGCCGCCTGGTAACACCGAAAATTACCGAGATCCTGGGCTTTAACtt  <  1:656673/62‑1 (MQ=255) atCCTGACGCCGTTCAGCCGCCTGGTAACACCGAAAATTACCGAGATCCTGGGCTTTAACtt  <  1:645323/62‑1 (MQ=255) atCCTGACGCCGTTCAGCCGCCTGGTAACACCGAAAATTACCGAGATCCTGGGCTTTAACtt  <  1:631186/62‑1 (MQ=255) atCCTGACGCCGTTCAGCCGCCTGGTAACACCGAAAATTACCGAGATCCTGGGCTTTAACtt  <  1:604963/62‑1 (MQ=255) atCCTGACGCCGTTCAGCCGCCTGGTAACACCGAAAATTACCGAGATCCTGGGCTTTAACtt  <  1:586440/62‑1 (MQ=255) atCCTGACGCCGTTCAGCCGCCTGGTAACACCGAAAATTACCGAGATCCTGGGCTTTAACtt  <  1:573541/62‑1 (MQ=255) atCCTGACGCCGTTCAGCCGCCTGGTAACACCGAAAATTACCGAGATCCTGGGCTTTAACtt  <  1:1089561/62‑1 (MQ=255) atCCTGACGCCGTTCAGCCGCCTGGTAACACCGAAAATTACCGAGATCCTGGGCTTTAACtt  <  1:43765/62‑1 (MQ=255) atCCTGACGCCGTTCAGCCGCCTGGTAACACCGAAAATTACCGAGATCCTGGGCTTTAACtt  <  1:41877/62‑1 (MQ=255) atCCTGACGCCGTTCAGCCGCCTGGTAACACCGAAAATTACCGAGATCCTGGGCTTTAACtt  <  1:416012/62‑1 (MQ=255) atCCTGACGCCGTTCAGCCGCCTGGTAACACCGAAAATTACCGAGATCCTGGGCTTTAACtt  <  1:410358/62‑1 (MQ=255) atCCTGACGCCGTTCAGCCGCCTGGTAACACCGAAAATTACCGAGATCCTGGGCTTTAACtt  <  1:312374/62‑1 (MQ=255) atCCTGACGCCGTTCAGCCGCCTGGTAACACCGAAAATTACCGAGATCCTGGGCTTTAACtt  <  1:231023/62‑1 (MQ=255) atCCTGACGCCGTTCAGCCGCCTGGTAACACCGAAAATTACCGAGATCCTGGGCTTTAACtt  <  1:119293/62‑1 (MQ=255) atCCTGACGCCGTTCAGCCGCCTGGTAACACCGAAAATTACCGAGATCCTGGGCTTTAACtt  <  1:118331/62‑1 (MQ=255) atCCTGACGCCGTTCAGCCGCCTGGTAACACCGAAAATTACCGAGATCCTGGGCTTTAACtt  <  1:1146308/62‑1 (MQ=255) atCCTGACGCCGTTCAGCCGCCTGGTAACACCGAAAATTACCGAGATCCTGGGCTTTAACtt  <  1:1095260/62‑1 (MQ=255)  tCCTGACGCCGTTCAGCCGCCTGGTAACACCGAAAATTACCGAGATCCTGGGCTTTAACtt  <  1:428802/61‑1 (MQ=255)  tCCTGACGCCGTTCAGCCGCCTGGTAACACCGAAAATTACCGAGATCCTGGGCTTTAACtt  <  1:584921/61‑1 (MQ=255)  tCCTGACGCCGTTCAGCCGCCTGGTAACACCGAAAATTACCGAGATCCTGGGCTTTAACtt  <  1:304554/61‑1 (MQ=255)  tCCTGACGCCGTTCAGCCGCCTGGTAACACCGAAAATTACCGAGATCCTGGGCTTTAACtt  <  1:269096/61‑1 (MQ=255)  tCCTGACGCCGTTCAGCCGCCTGGTAACACCGAAAATTACCGAGATCCTGGGCTTTAACtt  <  1:121373/61‑1 (MQ=255)                           aaCACCGAAAATTACCGAGATCCTGGGCTTTAACtt  <  1:907195/36‑1 (MQ=255)                                                              | ATCCTGACGCCGTTCAGCCGCCTGGTAACACCGAAAATTACCGAGATCCTGGGCTTTAACTT  >  minE/1821285‑1821346

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑