Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1829815	1829833	19	75 [0]	[0] 63	pphB	serine/threonine‑specific protein phosphatase 2

AGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACT  >  minE/1829766‑1829814                                                 | aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:577040/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:687172/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:683686/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:668660/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:645339/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:633370/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:632417/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:622152/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:604066/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:59540/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:697752/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:562506/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:556791/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:553818/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:546109/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:544818/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:531448/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:495162/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:487016/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:87720/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:965694/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:942817/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:942341/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:940612/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:936050/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:930252/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:919645/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:890487/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:456215/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:86616/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:855232/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:825987/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:822054/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:786322/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:75575/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:738808/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:707213/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:1111205/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:195322/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:189992/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:185563/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:122622/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:120452/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:1192397/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:1183024/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:1164703/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:1111530/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:448962/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:1105278/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:1090635/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:1088180/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:1072296/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:1046067/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:1017414/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:1008605/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:1005928/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:235939/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:1003669/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:426091/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:421597/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:414311/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:413419/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:405465/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:398206/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:396777/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:361394/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:33214/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:32367/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:273918/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:243623/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:242478/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:237365/49‑1 (MQ=255) aGATCTGTTGCCGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:378838/49‑1 (MQ=255)       gTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:198442/43‑1 (MQ=255)              aaaTTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACt  <  1:553167/36‑1 (MQ=255)                                                 | AGATCTGTTGCTGAAATTCCATCACCTTCCACATATTATTGAAATCACT  >  minE/1829766‑1829814

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑