Missing coverage evidence...
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CACGCCGTTTACGGTCTTCTCTCCGGCCCTGCCGGTCAACGGACGTACGGTTTATCAGGG  >  minE/1832320‑1832379                                                            | cacTCCGTTTACGGTCTTCTCTCCGGCCCTGCCGGTCAACGGACGTACGGTTTATCAggg  <  1:451721/60‑1 (MQ=255) cacGCCGTTTACGGTCTTCTCTCCGGCCCTGCTGGTCAACGGACGTACGGTTTATCAggg  <  1:1113457/60‑1 (MQ=255) cacGCCGTTTACGGTCTTCTCTCCGGCCCTGCCGGTCAACGGACGTACGGTTTATCAtgg  <  1:789401/60‑1 (MQ=255) cacGCCGTTTACGGTCTTCTCTCCGGCCCTGCCGGTCAACGGACGTACGGTTTATCAggg  <  1:501559/60‑1 (MQ=255) cacGCCGTTTACGGTCTTCTCTCCGGCCCTGCCGGTCAACGGACGTACGGTTTATCAggg  <  1:984225/60‑1 (MQ=255) cacGCCGTTTACGGTCTTCTCTCCGGCCCTGCCGGTCAACGGACGTACGGTTTATCAggg  <  1:975342/60‑1 (MQ=255) cacGCCGTTTACGGTCTTCTCTCCGGCCCTGCCGGTCAACGGACGTACGGTTTATCAggg  <  1:934888/60‑1 (MQ=255) cacGCCGTTTACGGTCTTCTCTCCGGCCCTGCCGGTCAACGGACGTACGGTTTATCAggg  <  1:864551/60‑1 (MQ=255) cacGCCGTTTACGGTCTTCTCTCCGGCCCTGCCGGTCAACGGACGTACGGTTTATCAggg  <  1:813766/60‑1 (MQ=255) cacGCCGTTTACGGTCTTCTCTCCGGCCCTGCCGGTCAACGGACGTACGGTTTATCAggg  <  1:787269/60‑1 (MQ=255) cacGCCGTTTACGGTCTTCTCTCCGGCCCTGCCGGTCAACGGACGTACGGTTTATCAggg  <  1:75887/60‑1 (MQ=255) cacGCCGTTTACGGTCTTCTCTCCGGCCCTGCCGGTCAACGGACGTACGGTTTATCAggg  <  1:658287/60‑1 (MQ=255) cacGCCGTTTACGGTCTTCTCTCCGGCCCTGCCGGTCAACGGACGTACGGTTTATCAggg  <  1:629257/60‑1 (MQ=255) cacGCCGTTTACGGTCTTCTCTCCGGCCCTGCCGGTCAACGGACGTACGGTTTATCAggg  <  1:590986/60‑1 (MQ=255) cacGCCGTTTACGGTCTTCTCTCCGGCCCTGCCGGTCAACGGACGTACGGTTTATCAggg  <  1:588593/60‑1 (MQ=255) cacGCCGTTTACGGTCTTCTCTCCGGCCCTGCCGGTCAACGGACGTACGGTTTATCAggg  <  1:542896/60‑1 (MQ=255) cacGCCGTTTACGGTCTTCTCTCCGGCCCTGCCGGTCAACGGACGTACGGTTTATCAggg  <  1:522729/60‑1 (MQ=255) cacGCCGTTTACGGTCTTCTCTCCGGCCCTGCCGGTCAACGGACGTACGGTTTATCAggg  <  1:1028335/60‑1 (MQ=255) cacGCCGTTTACGGTCTTCTCTCCGGCCCTGCCGGTCAACGGACGTACGGTTTATCAggg  <  1:458158/60‑1 (MQ=255) cacGCCGTTTACGGTCTTCTCTCCGGCCCTGCCGGTCAACGGACGTACGGTTTATCAggg  <  1:453195/60‑1 (MQ=255) cacGCCGTTTACGGTCTTCTCTCCGGCCCTGCCGGTCAACGGACGTACGGTTTATCAggg  <  1:324380/60‑1 (MQ=255) cacGCCGTTTACGGTCTTCTCTCCGGCCCTGCCGGTCAACGGACGTACGGTTTATCAggg  <  1:228066/60‑1 (MQ=255) cacGCCGTTTACGGTCTTCTCTCCGGCCCTGCCGGTCAACGGACGTACGGTTTATCAggg  <  1:208263/60‑1 (MQ=255) cacGCCGTTTACGGTCTTCTCTCCGGCCCTGCCGGTCAACGGACGTACGGTTTATCAggg  <  1:160589/60‑1 (MQ=255) cacGCCGTTTACGGTCTTCTCTCCGGCCCTGCCGGTCAACGGACGTACGGTTTATCAggg  <  1:125587/60‑1 (MQ=255) cacGCCGTTTACGGTCTTCTCTCCGGCCCTGCCGGTCAACGGACGTACGGTTTATCAggg  <  1:1193859/60‑1 (MQ=255) cacGCCGTTTACGGTCTTCTCTCCGGCCCTGCCGGTCAACGGACGTACGGTTTATCAggg  <  1:1072732/60‑1 (MQ=255) cacGCCGTTTACGGTCTTCTCTCCGGCCCTGCCGGTCAACGGACGTACGGTTTATCAggg  <  1:1066906/60‑1 (MQ=255) cacGCCGTTTACGGTCTTCTCTCCGGCCCTGCCAGTCAACGGACGTACGGTTTATCAggg  <  1:1047772/60‑1 (MQ=255)                                                            | CACGCCGTTTACGGTCTTCTCTCCGGCCCTGCCGGTCAACGGACGTACGGTTTATCAGGG  >  minE/1832320‑1832379

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑