Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1840766	1840773	8	49 [0]	[0] 23	truD	pseudoruidine synthase

TCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATG  >  minE/1840731‑1840765                                   | tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGTGCATg  >  1:80023/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:766266/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:381805/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:436103/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:462088/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:514437/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:538543/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:589000/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:589451/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:637766/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:640306/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:666509/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:708603/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:752772/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:378905/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:778021/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:788559/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:812447/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:824706/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:8792/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:897055/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:94000/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:941123/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:95666/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:977057/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:205070/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:1046546/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:1055001/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:115894/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:1179834/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:1194059/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:1197843/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:123191/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:127976/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:135577/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:15841/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:188468/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:219872/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:257802/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:260679/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:271392/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:285876/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:325441/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:32887/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:331461/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:340035/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:344074/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:349184/1‑35 (MQ=255) tCTTTTTACCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATg  >  1:1042096/1‑35 (MQ=255)                                   | TCTTTTTGCCCAGCGAAGCTGACTTCACGGGCATG  >  minE/1840731‑1840765

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑