Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1854553	1854566	14	32 [0]	[0] 2	ygcB	conserved hypothetical protein, member of DEAD box family

ATCATCGTAAATGCTATCCAGCCATTGCCGGTAAGCATCAGGGAAAAATAAGGATGCTCCAT  >  minE/1854491‑1854552                                                              | atcatcGTAAATTCTATCCAGCCATTGCCGGTAAGCATCAGGGAAAAATAAGGATGCTCCAt  <  1:162787/62‑1 (MQ=255) atcatcGTAAATGCTATCCAGCCATTGCCGGTAAGCATCAGGGAAAAATAAGGATGCTCCAt  <  1:50509/62‑1 (MQ=255) atcatcGTAAATGCTATCCAGCCATTGCCGGTAAGCATCAGGGAAAAATAAGGATGCTCCAt  <  1:946509/62‑1 (MQ=255) atcatcGTAAATGCTATCCAGCCATTGCCGGTAAGCATCAGGGAAAAATAAGGATGCTCCAt  <  1:910882/62‑1 (MQ=255) atcatcGTAAATGCTATCCAGCCATTGCCGGTAAGCATCAGGGAAAAATAAGGATGCTCCAt  <  1:843300/62‑1 (MQ=255) atcatcGTAAATGCTATCCAGCCATTGCCGGTAAGCATCAGGGAAAAATAAGGATGCTCCAt  <  1:834467/62‑1 (MQ=255) atcatcGTAAATGCTATCCAGCCATTGCCGGTAAGCATCAGGGAAAAATAAGGATGCTCCAt  <  1:818997/62‑1 (MQ=255) atcatcGTAAATGCTATCCAGCCATTGCCGGTAAGCATCAGGGAAAAATAAGGATGCTCCAt  <  1:759221/62‑1 (MQ=255) atcatcGTAAATGCTATCCAGCCATTGCCGGTAAGCATCAGGGAAAAATAAGGATGCTCCAt  <  1:680858/62‑1 (MQ=255) atcatcGTAAATGCTATCCAGCCATTGCCGGTAAGCATCAGGGAAAAATAAGGATGCTCCAt  <  1:646765/62‑1 (MQ=255) atcatcGTAAATGCTATCCAGCCATTGCCGGTAAGCATCAGGGAAAAATAAGGATGCTCCAt  <  1:62897/62‑1 (MQ=255) atcatcGTAAATGCTATCCAGCCATTGCCGGTAAGCATCAGGGAAAAATAAGGATGCTCCAt  <  1:620132/62‑1 (MQ=255) atcatcGTAAATGCTATCCAGCCATTGCCGGTAAGCATCAGGGAAAAATAAGGATGCTCCAt  <  1:609796/62‑1 (MQ=255) atcatcGTAAATGCTATCCAGCCATTGCCGGTAAGCATCAGGGAAAAATAAGGATGCTCCAt  <  1:603624/62‑1 (MQ=255) atcatcGTAAATGCTATCCAGCCATTGCCGGTAAGCATCAGGGAAAAATAAGGATGCTCCAt  <  1:564328/62‑1 (MQ=255) atcatcGTAAATGCTATCCAGCCATTGCCGGTAAGCATCAGGGAAAAATAAGGATGCTCCAt  <  1:1007481/62‑1 (MQ=255) atcatcGTAAATGCTATCCAGCCATTGCCGGTAAGCATCAGGGAAAAATAAGGATGCTCCAt  <  1:384695/62‑1 (MQ=255) atcatcGTAAATGCTATCCAGCCATTGCCGGTAAGCATCAGGGAAAAATAAGGATGCTCCAt  <  1:377731/62‑1 (MQ=255) atcatcGTAAATGCTATCCAGCCATTGCCGGTAAGCATCAGGGAAAAATAAGGATGCTCCAt  <  1:357435/62‑1 (MQ=255) atcatcGTAAATGCTATCCAGCCATTGCCGGTAAGCATCAGGGAAAAATAAGGATGCTCCAt  <  1:256993/62‑1 (MQ=255) atcatcGTAAATGCTATCCAGCCATTGCCGGTAAGCATCAGGGAAAAATAAGGATGCTCCAt  <  1:251125/62‑1 (MQ=255) atcatcGTAAATGCTATCCAGCCATTGCCGGTAAGCATCAGGGAAAAATAAGGATGCTCCAt  <  1:235679/62‑1 (MQ=255) atcatcGTAAATGCTATCCAGCCATTGCCGGTAAGCATCAGGGAAAAATAAGGATGCTCCAt  <  1:113047/62‑1 (MQ=255) atcatcGTAAATGCTATCCAGCCATTGCCGGTAAGCATCAGGGAAAAATAAGGATGCTCCAt  <  1:1112180/62‑1 (MQ=255) atcatcGTAAATGCTATCCAGCCATTGCCGGTAAGCATCAGGGAAAAATAAGGATGCTCCAt  <  1:1090309/62‑1 (MQ=255) atcatcGTAAATGCTATCCAGCCATTGCCGGTAAGCATCAGGGAAAAATAAGGATGCTCCAt  <  1:1087498/62‑1 (MQ=255) atcatcGTAAATGCTATCCAGCCATTGCCGGTAAGCATCAGGGAAAAATAAGGATGCTCCAt  <  1:107905/62‑1 (MQ=255) atcatcGTAAATGCTATCCAGCCATTGCCGGTAAGCATCAGGGAAAAATAAGGATGCTCCAt  <  1:1055429/62‑1 (MQ=255) atcatcGTAAATGCTATCCAGCCATTGCCGGTAAGCATCAGGGAAAAATAAGGATGCTCCAt  <  1:1024111/62‑1 (MQ=255)  tcatcGTAAATGCTATCCAGCCATTGCCGGTAAGCATCAGGGAAAAATAAGGATGCTCCAt  <  1:544539/61‑1 (MQ=255)  tcatcGTAAATGCTATCCAGCCATTGCCGGTAAGCATCAGGGAAAAATAAGGATGCTCCAt  <  1:356097/61‑1 (MQ=255)     tcGTAAATGCTATCCAGCCATTGCCGGTAATCATCAGGGAAAAATAAGGATGCTCCAt  <  1:678659/58‑1 (MQ=255)                                                              | ATCATCGTAAATGCTATCCAGCCATTGCCGGTAAGCATCAGGGAAAAATAAGGATGCTCCAT  >  minE/1854491‑1854552

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑