Missing coverage evidence...
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AGCGCCTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTT  >  minE/1861895‑1861956                                                              | aGCGCCTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGtt  <  1:431331/62‑1 (MQ=255) aGCGCCTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGtt  <  1:939295/62‑1 (MQ=255) aGCGCCTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGtt  <  1:81970/62‑1 (MQ=255) aGCGCCTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGtt  <  1:737616/62‑1 (MQ=255) aGCGCCTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGtt  <  1:669927/62‑1 (MQ=255) aGCGCCTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGtt  <  1:626730/62‑1 (MQ=255) aGCGCCTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGtt  <  1:617956/62‑1 (MQ=255) aGCGCCTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGtt  <  1:505329/62‑1 (MQ=255) aGCGCCTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGtt  <  1:1022220/62‑1 (MQ=255) aGCGCCTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGtt  <  1:392864/62‑1 (MQ=255) aGCGCCTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGtt  <  1:385453/62‑1 (MQ=255) aGCGCCTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGtt  <  1:3384/62‑1 (MQ=255) aGCGCCTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGtt  <  1:328395/62‑1 (MQ=255) aGCGCCTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGtt  <  1:18796/62‑1 (MQ=255) aGCGCCTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGtt  <  1:109078/62‑1 (MQ=255) aGCGCCTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGtt  <  1:1050650/62‑1 (MQ=255) aGCGCCTCGATCACCATTATCT‑AATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGtt  <  1:102684/61‑1 (MQ=255)  gcgcCTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGtt  <  1:349453/61‑1 (MQ=255)  gcgcCTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGtt  <  1:753176/61‑1 (MQ=255)             aCCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGtt  <  1:884695/50‑1 (MQ=255)                                                              | AGCGCCTCGATCACCATTATCTCAATGATATTCCAGGTCTGGAAAACCCAACCAGCGAGGTT  >  minE/1861895‑1861956

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑