Missing coverage evidence...
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GCGCTCGGTATGCTGCATGACAAACTCTCGACCAAAGGCGTGAAGTTCGTCGGCTACTGGCC  >  minE/1939420‑1939481 |                                                              gcgcTCTGTATGCTGCATGACAAACTCTCGACCAAAGGCGTGAAGTTCGTCGGCTACTGGcc  >  1:508432/1‑62 (MQ=255) gcgcTCGGTATGCTGCATGACAAACTCTCGACCAAAgg                          >  1:328018/1‑38 (MQ=255) gcgcTCGGTATGCTGCATGACAAACTCTCGACCAAAGGCGTGAAGTTCGTCGGCTACTGGcc  >  1:381226/1‑62 (MQ=255) gcgcTCGGTATGCTGCATGACAAACTCTCGACCAAAGGCGTGAAGTTCGTCGGCTACTGGcc  >  1:877838/1‑62 (MQ=255) gcgcTCGGTATGCTGCATGACAAACTCTCGACCAAAGGCGTGAAGTTCGTCGGCTACTGGcc  >  1:842040/1‑62 (MQ=255) gcgcTCGGTATGCTGCATGACAAACTCTCGACCAAAGGCGTGAAGTTCGTCGGCTACTGGcc  >  1:802027/1‑62 (MQ=255) gcgcTCGGTATGCTGCATGACAAACTCTCGACCAAAGGCGTGAAGTTCGTCGGCTACTGGcc  >  1:637625/1‑62 (MQ=255) gcgcTCGGTATGCTGCATGACAAACTCTCGACCAAAGGCGTGAAGTTCGTCGGCTACTGGcc  >  1:588806/1‑62 (MQ=255) gcgcTCGGTATGCTGCATGACAAACTCTCGACCAAAGGCGTGAAGTTCGTCGGCTACTGGcc  >  1:580219/1‑62 (MQ=255) gcgcTCGGTATGCTGCATGACAAACTCTCGACCAAAGGCGTGAAGTTCGTCGGCTACTGGcc  >  1:402507/1‑62 (MQ=255) gcgcTCGGTATGCTGCATGACAAACTCTCGACCAAAGGCGTGAAGTTCGTCGGCTACTGGcc  >  1:385196/1‑62 (MQ=255) gcgcTCGGTATGCTGCATGACAAACTCTCGACCAAAGGCGTGAAGTTCGTCGGCTACTGGcc  >  1:1014064/1‑62 (MQ=255) gcgcTCGGTATGCTGCATGACAAACTCTCGACCAAAGGCGTGAAGTTCGTCGGCTACTGGcc  >  1:284194/1‑62 (MQ=255) gcgcTCGGTATGCTGCATGACAAACTCTCGACCAAAGGCGTGAAGTTCGTCGGCTACTGGcc  >  1:278763/1‑62 (MQ=255) gcgcTCGGTATGCTGCATGACAAACTCTCGACCAAAGGCGTGAAGTTCGTCGGCTACTGGcc  >  1:253655/1‑62 (MQ=255) gcgcTCGGTATGCTGCATGACAAACTCTCGACCAAAGGCGTGAAGTTCGTCGGCTACTGGcc  >  1:231793/1‑62 (MQ=255) gcgcTCGGTATGCTGCATGACAAACTCTCGACCAAAGGCGTGAAGTTCGTCGGCTACTGGcc  >  1:189203/1‑62 (MQ=255) gcgcTCGGTATGCTGCATGACAAACTCTCGACCAAAGGCGTGAAGTTCGTCGGCTACTGGcc  >  1:134383/1‑62 (MQ=255) gcgcTCGGTATGCTGCATGACAAACTCTCGACCAAAGGCGTGAAGTTCGTCGGCTACTGGcc  >  1:1203297/1‑62 (MQ=255) gcgcTCGGTATGCTGCATGACAAACTCTCGACCAAAGGCGTGAAGTTCGTCGGCTACTGGcc  >  1:1171556/1‑62 (MQ=255) gcgcTCGGTATGCTGCATGACAAACTCTCGACCAAAGGCGTGAAGTTCATCGGCTACTGGcc  >  1:623943/1‑62 (MQ=255) gcgcTCGGTATGCTGCATGACAAACTCTCGACCAAAGGCGTGAAGTTAGTCGGCTACTGGcc  >  1:28911/1‑62 (MQ=255) |                                                              GCGCTCGGTATGCTGCATGACAAACTCTCGACCAAAGGCGTGAAGTTCGTCGGCTACTGGCC  >  minE/1939420‑1939481

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑