Missing coverage evidence...
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CAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTT  >  minE/1951859‑1951920 |                                                              cAAGACTTATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGtt  >  1:1279/1‑62 (MQ=255) cAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAACCCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGtt  >  1:856796/1‑62 (MQ=255) cAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCgg                   >  1:361088/1‑45 (MQ=255) cAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCagaggt  >  1:369658/1‑60 (MQ=255) cAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGtt  >  1:438558/1‑62 (MQ=255) cAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGtt  >  1:999495/1‑62 (MQ=255) cAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGtt  >  1:928303/1‑62 (MQ=255) cAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGtt  >  1:921348/1‑62 (MQ=255) cAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGtt  >  1:852566/1‑62 (MQ=255) cAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGtt  >  1:845050/1‑62 (MQ=255) cAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGtt  >  1:819347/1‑62 (MQ=255) cAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGtt  >  1:792525/1‑62 (MQ=255) cAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGtt  >  1:742194/1‑62 (MQ=255) cAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGtt  >  1:671595/1‑62 (MQ=255) cAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGtt  >  1:585896/1‑62 (MQ=255) cAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGtt  >  1:528844/1‑62 (MQ=255) cAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGtt  >  1:502982/1‑62 (MQ=255) cAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGtt  >  1:1010563/1‑62 (MQ=255) cAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGtt  >  1:429680/1‑62 (MQ=255) cAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGtt  >  1:414529/1‑62 (MQ=255) cAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGtt  >  1:318402/1‑62 (MQ=255) cAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGtt  >  1:304355/1‑62 (MQ=255) cAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGtt  >  1:261934/1‑62 (MQ=255) cAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGtt  >  1:21094/1‑62 (MQ=255) cAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGtt  >  1:195358/1‑62 (MQ=255) cAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGtt  >  1:1183253/1‑62 (MQ=255) cAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGtt  >  1:1139896/1‑62 (MQ=255) |                                                              CAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTT  >  minE/1951859‑1951920

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑