Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1953977	1953997	21	5 [0]	[0] 43	pepP	proline aminopeptidase P II

GCTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTCCA  >  minE/1953998‑1954059 |                                                              gcTACGTGTTAGTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:155073/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCTCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:138949/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:785045/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:513145/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:52858/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:54354/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:550648/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:561958/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:613766/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:631790/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:644473/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:717266/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:734564/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:773750/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:491102/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:786716/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:802478/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:80390/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:832575/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:872506/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:888431/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:900036/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:905329/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:335857/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:1041030/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:1046696/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:1055194/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:131151/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:191262/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:270659/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:272204/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:293467/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:314584/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:495098/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:382757/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:385534/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:420065/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:463129/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:468768/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:473750/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:477993/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:478885/62‑1 (MQ=255) gcTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTcca  <  1:1029730/62‑1 (MQ=255) |                                                              GCTACGTGTTACTTCTGGTGCAGCAAAAATCAGCGCGGCGCTGCCGGGTTGCATTTGCTCCA  >  minE/1953998‑1954059

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑