Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1966403	1966433	31	2 [0]	[0] 39	cmtA/tktA	predicted fused mannitol‑specific enzyme IIBC component of PTS/transketolase 1, thiamin‑binding

ATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATC  >  minE/1966434‑1966495 |                                                              attattAATTTTTTATATAACATTGAGATATAGATATAACATCAAATGTCAATACGCatata  >  1:625158/1‑61 (MQ=255) attattAATTTCTTTTATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:771304/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCatat   >  1:881064/1‑61 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:678672/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:370564/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:385659/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:419599/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:499933/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:612975/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:62512/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:671513/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:675256/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:338243/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:724724/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:771816/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:799509/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:841838/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:889489/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:901152/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:958950/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:139863/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:1033385/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:1049947/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:1069246/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:1105269/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:1110117/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:1117401/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:1138369/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:1198151/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:137031/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:1011360/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:143643/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:255686/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:264440/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:276394/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:290966/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATc  >  1:318630/1‑62 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAAAGTCAATACGCatat   >  1:254812/1‑61 (MQ=255) attattAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAAAAAATGTCAATACGCATATc  >  1:165898/1‑62 (MQ=255) |                                                              ATTATTAATTTCTTATATAACATTGAGTTATAGATATAACAACAAATGTCAATACGCATATC  >  minE/1966434‑1966495

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑