Missing coverage evidence...
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CGTGCGGGCCAGGCGCTGCACAGGTGTAGATCCGAGACGTTATGCTTTACACTAAGGGCCAC  >  minE/1981995‑1982056 |                                                              cGTTCGGGCCAGGCGCTGCACAGGTGTAGATCCGAGACGTTATGCTTTACACTAAGGGCcac  <  1:982446/62‑1 (MQ=255) cGTGCGGGCCAGGCGCTGCACAGGTGTAGATCCTAGACGTTATGCTTTACACTAAGGGCcac  <  1:450202/62‑1 (MQ=255) cGTGCGGGCCAGGCGCTGCACAGGTGTAGATCCGAGACGTTATGCTTTACACTAAGGGCcac  <  1:392001/62‑1 (MQ=255) cGTGCGGGCCAGGCGCTGCACAGGTGTAGATCCGAGACGTTATGCTTTACACTAAGGGCcac  <  1:983114/62‑1 (MQ=255) cGTGCGGGCCAGGCGCTGCACAGGTGTAGATCCGAGACGTTATGCTTTACACTAAGGGCcac  <  1:869251/62‑1 (MQ=255) cGTGCGGGCCAGGCGCTGCACAGGTGTAGATCCGAGACGTTATGCTTTACACTAAGGGCcac  <  1:833282/62‑1 (MQ=255) cGTGCGGGCCAGGCGCTGCACAGGTGTAGATCCGAGACGTTATGCTTTACACTAAGGGCcac  <  1:548836/62‑1 (MQ=255) cGTGCGGGCCAGGCGCTGCACAGGTGTAGATCCGAGACGTTATGCTTTACACTAAGGGCcac  <  1:547176/62‑1 (MQ=255) cGTGCGGGCCAGGCGCTGCACAGGTGTAGATCCGAGACGTTATGCTTTACACTAAGGGCcac  <  1:542668/62‑1 (MQ=255) cGTGCGGGCCAGGCGCTGCACAGGTGTAGATCCGAGACGTTATGCTTTACACTAAGGGCcac  <  1:540452/62‑1 (MQ=255) cGTGCGGGCCAGGCGCTGCACAGGTGTAGATCCGAGACGTTATGCTTTACACTAAGGGCcac  <  1:532467/62‑1 (MQ=255) cGTGCGGGCCAGGCGCTGCACAGGTGTAGATCCGAGACGTTATGCTTTACACTAAGGGCcac  <  1:495228/62‑1 (MQ=255) cGTGCGGGCCAGGCGCTGCACAGGTGTAGATCCGAGACGTTATGCTTTACACTAAGGGCcac  <  1:10179/62‑1 (MQ=255) cGTGCGGGCCAGGCGCTGCACAGGTGTAGATCCGAGACGTTATGCTTTACACTAAGGGCcac  <  1:340207/62‑1 (MQ=255) cGTGCGGGCCAGGCGCTGCACAGGTGTAGATCCGAGACGTTATGCTTTACACTAAGGGCcac  <  1:316307/62‑1 (MQ=255) cGTGCGGGCCAGGCGCTGCACAGGTGTAGATCCGAGACGTTATGCTTTACACTAAGGGCcac  <  1:301692/62‑1 (MQ=255) cGTGCGGGCCAGGCGCTGCACAGGTGTAGATCCGAGACGTTATGCTTTACACTAAGGGCcac  <  1:223641/62‑1 (MQ=255) cGTGCGGGCCAGGCGCTGCACAGGTGTAGATCCGAGACGTTATGCTTTACACTAAGGGCcac  <  1:222848/62‑1 (MQ=255) cGTGCGGGCCAGGCGCTGCACAGGTGTAGATCCGAGACGTTATGCTTTACACTAAGGGCcac  <  1:216252/62‑1 (MQ=255) cGTGCGGGCCAGGCGCTGCACAGGTGTAGATCCGAGACGTTATGCTTTACACTAAGGGCcac  <  1:1182853/62‑1 (MQ=255) cGTGCGGGCCAGGCGCTGCACAGGTGTAGATCCGAGACGTTATGCTTTACACTAAGGGCcac  <  1:1175247/62‑1 (MQ=255) cGTGCGGGCCAGGCGCTGCACAGGTGTAGATCCGAGACGTTATGCTTTACACTAAGGGCcac  <  1:1144505/62‑1 (MQ=255) cGTGCGGGCCAGGCGCTGCACAGGTGTAGATCCGAGACGTTATGCTTTACACTAAGGGCcac  <  1:1057206/62‑1 (MQ=255) cGTGCGGGCCAGGCGCTGCACAGGTGTAGATCCGAGACGTTATGCTTTACACTAAGGGCcac  <  1:1032747/62‑1 (MQ=255) cGTGCGGGCCAGGCGCTGCACAGGGGTAGATCCGAGACGTTATGCTTTACACTAAGGGCcac  <  1:50705/62‑1 (MQ=255) |                                                              CGTGCGGGCCAGGCGCTGCACAGGTGTAGATCCGAGACGTTATGCTTTACACTAAGGGCCAC  >  minE/1981995‑1982056

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑