Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1982389	1982801	413	20 [1]	[0] 100	[yggS]	[yggS]

TAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAT  >  minE/1982802‑1982863 |                                                              tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCACCGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:164891/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCa                  >  1:906239/1‑46 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGta        >  1:998987/1‑56 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCa   >  1:756415/1‑61 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCa   >  1:223292/1‑61 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCa   >  1:212716/1‑61 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCa   >  1:1102291/1‑61 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCa   >  1:92189/1‑61 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCa   >  1:775970/1‑61 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCa   >  1:633713/1‑61 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCa   >  1:145334/1‑61 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:700959/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:474692/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:66423/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:660373/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:707463/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:627338/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:625198/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:619925/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:603948/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:593146/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:577270/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:574907/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:570573/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:560681/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:55729/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:551025/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:54998/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:534268/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:525903/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:481817/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:44976/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:866133/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:993962/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:948299/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:941603/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:933474/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:931727/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:899254/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:894030/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:886946/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:869791/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:869181/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:721925/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:843229/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:836429/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:832094/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:82343/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:818753/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:814611/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:782129/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:770457/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:767643/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:1161710/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:45802/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:199641/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:186387/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:175717/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:157152/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:13990/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:1283/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:127183/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:1185979/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:1070055/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:1165982/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:223675/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:1157709/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:1156119/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:1150854/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:1113410/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:1110251/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:1104465/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:1092909/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:1087157/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:1073767/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:1070671/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:343738/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:454023/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:1020556/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:447663/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:446258/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:425182/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:407753/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:406579/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:396741/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:378521/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:368237/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:341105/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:327799/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:323195/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:307054/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:298090/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:291535/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:276619/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:264630/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:260082/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:243306/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGATGTATACCAt  >  1:1024017/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTCCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAt  >  1:1165991/1‑62 (MQ=255) tAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTGTCAACGGTCATTGAGCTGTATCCCa   >  1:217999/1‑61 (MQ=255) |                                                              TAAAGGAACGCCATGAATACGTTGACTTTCCTGCTTTCAACGGTCATTGAGCTGTATACCAT  >  minE/1982802‑1982863

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑