Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2040842	2040913	72	58 [0]	[1] 53	yqiH	predicted periplasmic pilin chaperone

GGAAAAAATTGCTCAACTTCCTAAAGACAGAGAAACGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGC  >  minE/2040881‑2040975                                  |                                                              ggAAAAAATTGCTCAACTTCCTAAAGACAGAGAAACGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGaaa                                   >  1:15543/1‑62 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:753914/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:487201/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:513272/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:537397/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:538911/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:559845/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:618328/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:619647/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:644708/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:66851/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:69214/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:698261/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:72230/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:728473/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:406873/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:763522/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:768256/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:778384/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:790613/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:818214/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:820057/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:861602/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:909367/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:920361/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:937009/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:99703/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:215425/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:107141/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:1169845/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:1173285/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:1174261/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:1190742/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:1192086/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:132550/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:14468/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:148797/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:196677/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:20945/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:478123/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:26659/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:279821/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:298704/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:318888/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:358573/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:366857/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:36887/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:373915/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:397425/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:401171/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGc  <  1:102121/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAACGTGATGc  <  1:241032/62‑1 (MQ=255)                                  aaCGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAACGTGATGc  <  1:1150253/62‑1 (MQ=255)                                  |                                                              GGAAAAAATTGCTCAACTTCCTAAAGACAGAGAAACGCTCTTCTATTTTAACGTGCGAGAAATACCGCCCTAAACAGATAAAAAAAATGTGATGC  >  minE/2040881‑2040975

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑